165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4716 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4716  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 432 aa  884    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4695  extracellular solute-binding protein family 1  96.76 
 
 		 432 aa  847    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.52565 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7337  ABC transporter substrate binding protein  64.47 
 
 		 431 aa  587  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00127436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  32.67 
 
 		 458 aa  230  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  33.25 
 
 		 432 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 411 aa  94  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 411 aa  93.6  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 428 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 425 aa  87.4  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  23.75 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.74 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.31 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.28 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  26.15 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.42 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  23.02 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  22.31 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.54 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  22.75 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  22.51 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  21.22 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1807  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2418  extracellular solute-binding protein family 1  28.25 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 421 aa  57  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.69 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 504 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.92 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  21.73 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  21.69 
 
 		 445 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 		 416 aa  54.3  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.56 
 
 		 410 aa  53.5  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 419 aa  53.5  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 420 aa  53.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  20.71 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 448 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  21.66 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.8 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 445 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2014  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 455 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  20.77 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 415 aa  50.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  27.65 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 441 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 435 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  21.13 
 
 		 430 aa  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>