More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1358 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1358  diguanylate cyclase  100 
 
 		 412 aa  803    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3052  diguanylate cyclase  44.07 
 
 		 410 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0736  diguanylate cyclase  40.13 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000330305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0840  diguanylate cyclase  41.3 
 
 		 411 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2632  GGDEF domain-containing protein  44.2 
 
 		 411 aa  229  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4080  diguanylate cyclase  42.24 
 
 		 439 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4678  GGDEF  40.66 
 
 		 432 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4000  diguanylate cyclase  42.07 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.133602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0505  GGDEF domain protein  41.19 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1703  diguanylate cyclase  36.86 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00246889  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0206  GGDEF domain-containing protein  37.76 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05730  sensory transduction protein kinase  33.84 
 
 		 393 aa  186  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1771  diguanylate cyclase  44.33 
 
 		 362 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4833  diguanylate cyclase  41.38 
 
 		 427 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2380  GGDEF family protein  34.91 
 
 		 413 aa  180  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0242852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0436  membrane associated GGDEF protein  35.06 
 
 		 410 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0325  diguanylate cyclase  39.75 
 
 		 394 aa  179  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0399  diguanylate cyclase  41.07 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0245  GGDEF domain-containing protein  32.55 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000123  GGDEF domain protein  33.03 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.608204  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3267  diguanylate cyclase  44.72 
 
 		 381 aa  176  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3991  diguanylate cyclase  44.1 
 
 		 396 aa  176  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0186  diguanylate cyclase  43.5 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0369  GGDEF domain-containing protein  40.75 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0652441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5168  diguanylate cyclase  39.8 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0395  diguanylate cyclase  40.75 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3494  diguanylate cyclase  34.86 
 
 		 384 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.316612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0020  diguanylate cyclase  32.34 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0077  diguanylate cyclase  45.36 
 
 		 411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978885  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1377  diguanylate cyclase  44.57 
 
 		 411 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0493  GGDEF family protein  36.4 
 
 		 412 aa  159  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0380455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0349  diguanylate cyclase  40.76 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.291431  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2748  diguanylate cyclase  42.55 
 
 		 352 aa  119  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246546  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  40.1 
 
 		 461 aa  116  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0109  diguanylate cyclase  37.16 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  42.22 
 
 		 457 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3412  diguanylate cyclase  29.74 
 
 		 346 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  37.89 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2596  diguanylate cyclase  40.64 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  39.25 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  37.84 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0410  diguanylate cyclase  38.83 
 
 		 657 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2123  diguanylate cyclase  37.71 
 
 		 635 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06694  hypothetical protein  37.68 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.71 
 
 		 820 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.29973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3487  diguanylate cyclase  38.95 
 
 		 345 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  40.43 
 
 		 457 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  38.17 
 
 		 457 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0747  diguanylate cyclase  37.89 
 
 		 508 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  40.53 
 
 		 510 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  40.53 
 
 		 510 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  40.53 
 
 		 510 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2126  diguanylate cyclase  37.23 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128443  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.71 
 
 		 499 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  36.22 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  38.17 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2490  diguanylate cyclase  35.68 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316308  normal  0.521612 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0092  diguanylate cyclase  35.6 
 
 		 577 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2867  diguanylate cyclase  34.43 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1213  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.18 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0172  GGDEF domain-containing protein  38.71 
 
 		 328 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.01 
 
 		 634 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  39.25 
 
 		 457 aa  106  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.16 
 
 		 557 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  39.44 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2481  diguanylate cyclase  38.71 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0443  GGDEF domain-containing protein  34.25 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0613635  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1814  diguanylate cyclase  41.57 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  36.11 
 
 		 1079 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1896  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.25 
 
 		 564 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133427  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.49 
 
 		 313 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.99 
 
 		 632 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2397  diguanylate cyclase  38.8 
 
 		 510 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00466  Putative two-component system regulatory protein with GGDEF domain  37.24 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.6149  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.23 
 
 		 800 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0426061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3254  diguanylate cyclase  35.53 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00411067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2834  diguanylate cyclase  36.49 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  36.36 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  27.31 
 
 		 564 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.57 
 
 		 457 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000797  GGDEF family protein  36.71 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  34.02 
 
 		 1034 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1126  diguanylate cyclase  35.96 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  35.79 
 
 		 631 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3440  diguanylate cyclase  35.98 
 
 		 557 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0125075  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  31.91 
 
 		 563 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3932  GGDEF domain-containing protein  35.68 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0460046  normal  0.0449819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4104  diguanylate cyclase  37.43 
 
 		 610 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.147884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3566  diguanylate cyclase  36.9 
 
 		 460 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000340192  normal  0.133927 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.43 
 
 		 550 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1193  diguanylate cyclase  36.65 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1780  diguanylate cyclase  36.07 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1602  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.51 
 
 		 638 aa  103  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000652876  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  36.84 
 
 		 457 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1864  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.57 
 
 		 457 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  0.121309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  35.52 
 
 		 638 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2966  diguanylate cyclase  36.33 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  decreased coverage  0.00586824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1305  GGDEF domain protein  37.67 
 
 		 502 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.620212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2363  GGDEF domain-containing protein  36.56 
 
 		 311 aa  103  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.282615  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3261  diguanylate cyclase  39.65 
 
 		 360 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.455053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>