More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000123 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05730  sensory transduction protein kinase  83.29 
 
 		 393 aa  692    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000123  GGDEF domain protein  100 
 
 		 412 aa  851    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.608204  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0493  GGDEF family protein  48.66 
 
 		 412 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0380455  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0436  membrane associated GGDEF protein  46.23 
 
 		 410 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2380  GGDEF family protein  35.15 
 
 		 413 aa  264  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0242852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4080  diguanylate cyclase  32.02 
 
 		 439 aa  207  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4678  GGDEF  41.37 
 
 		 432 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0840  diguanylate cyclase  33.86 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3052  diguanylate cyclase  36.41 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0736  diguanylate cyclase  32.35 
 
 		 412 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000330305  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2632  GGDEF domain-containing protein  32.52 
 
 		 411 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0245  GGDEF domain-containing protein  35.15 
 
 		 417 aa  196  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0206  GGDEF domain-containing protein  34.9 
 
 		 396 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3267  diguanylate cyclase  34.22 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4833  diguanylate cyclase  34.38 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1771  diguanylate cyclase  38.3 
 
 		 362 aa  189  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0399  diguanylate cyclase  34.12 
 
 		 427 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1703  diguanylate cyclase  45.33 
 
 		 405 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00246889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0369  GGDEF domain-containing protein  33.86 
 
 		 400 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0652441  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0505  GGDEF domain protein  34.21 
 
 		 431 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5168  diguanylate cyclase  39.72 
 
 		 442 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0395  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 425 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4000  diguanylate cyclase  47.31 
 
 		 426 aa  176  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.133602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0186  diguanylate cyclase  45.13 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3991  diguanylate cyclase  42.78 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3494  diguanylate cyclase  32.2 
 
 		 384 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.316612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1358  diguanylate cyclase  43.43 
 
 		 412 aa  162  7e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0077  diguanylate cyclase  49.72 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978885  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0020  diguanylate cyclase  44.63 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1377  diguanylate cyclase  44.5 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0325  diguanylate cyclase  41.78 
 
 		 394 aa  150  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0891  diguanylate cyclase  31.62 
 
 		 332 aa  110  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000797  GGDEF family protein  37.1 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2312  GGDEF domain-containing protein  37.36 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06694  hypothetical protein  32.76 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2490  diguanylate cyclase  35.06 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316308  normal  0.521612 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3487  diguanylate cyclase  35.9 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2408  diguanylate cyclase  36.78 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0892  diguanylate cyclase  27.6 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.501117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1163  diguanylate cyclase  33.18 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1062  diguanylate cyclase  35.64 
 
 		 566 aa  101  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0191664  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2514  diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 341 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.39605  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2446  diguanylate cyclase  36.21 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0209282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1879  diguanylate cyclase  36.21 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1845  diguanylate cyclase  36.21 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2198  diguanylate cyclase  36.21 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.83837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2275  diguanylate cyclase  36.21 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0283  GGDEF family protein  37.29 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.286485  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  29.79 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1741  diguanylate cyclase  35.63 
 
 		 341 aa  100  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2926  diguanylate cyclase  37.02 
 
 		 250 aa  99.8  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  35.64 
 
 		 339 aa  99.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0867  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.26 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.711393  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1425  diguanylate cyclase  36.22 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2596  diguanylate cyclase  35.98 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1306  diguanylate cyclase  30.88 
 
 		 615 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.550913  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05578  hypothetical protein  34.43 
 
 		 650 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4848  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.49 
 
 		 665 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2197  GGDEF family protein  36.72 
 
 		 341 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0415  diguanylate cyclase  31.32 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1759  GGDEF domain-containing protein  35.39 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.81 
 
 		 303 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.5 
 
 		 800 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0426061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1984  threonine dehydratase  39.1 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.241676  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1887  diguanylate cyclase  34.08 
 
 		 517 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2842  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.29 
 
 		 661 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947946 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0410  diguanylate cyclase  36.22 
 
 		 657 aa  98.6  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754716 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1831  diguanylate cyclase  35.63 
 
 		 341 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0533362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  36.96 
 
 		 455 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1597  GGDEF family protein  35.29 
 
 		 674 aa  98.2  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0570489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2459  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.75 
 
 		 335 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.685644  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001599  GGDEF domain protein  34.43 
 
 		 637 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.707658  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4621  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.87 
 
 		 648 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334588  normal  0.654105 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2126  diguanylate cyclase  34.48 
 
 		 341 aa  97.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128443  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0579  diguanylate cyclase  31.8 
 
 		 368 aa  97.4  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  36.96 
 
 		 696 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4330  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.04 
 
 		 325 aa  97.1  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1795  diguanylate cyclase  34.05 
 
 		 339 aa  97.1  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0462  3-deoxy-d-manno-octulosonic-acid transferase  34.24 
 
 		 422 aa  96.7  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3537  GGDEF family protein  33.15 
 
 		 393 aa  96.7  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  32.43 
 
 		 629 aa  96.7  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2293  diguanylate cyclase  30.34 
 
 		 467 aa  96.7  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000112238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1649  diguanylate cyclase  36.07 
 
 		 453 aa  96.3  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.103879  normal  0.646228 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  34.62 
 
 		 427 aa  95.5  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2390  TPR repeat-containing diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 		 600 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3232  hypothetical protein  36.26 
 
 		 498 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0640076  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  36.56 
 
 		 556 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0196  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 356 aa  95.9  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  36.61 
 
 		 466 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2370  diguanylate cyclase  33.7 
 
 		 342 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257282  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1004  GGDEF domain protein  27.41 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4052  diguanylate cyclase  32.09 
 
 		 416 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.0995443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2508  diguanylate cyclase  27.64 
 
 		 387 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0835  diguanylate cyclase  32.43 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153525  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2104  diguanylate cyclase  33.7 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  34.57 
 
 		 714 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2092  diguanylate cyclase  33.7 
 
 		 342 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0157551  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1161  diguanylate cyclase  38.85 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0876222  normal  0.647833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4428  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2253  diguanylate cyclase  33.7 
 
 		 342 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0242555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>