More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0835 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0835  diguanylate cyclase  100 
 
 		 443 aa  881    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01754  predicted diguanylate cyclase  38.5 
 
 		 491 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1871  diguanylate cyclase  38.5 
 
 		 491 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0774935  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1847  diguanylate cyclase  38.5 
 
 		 491 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.02251 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01742  hypothetical protein  38.5 
 
 		 491 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2009  diguanylate cyclase  38.5 
 
 		 491 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1857  diguanylate cyclase  38.5 
 
 		 491 aa  273  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00173388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1406  diguanylate cyclase  38.5 
 
 		 444 aa  272  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2509  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  38.26 
 
 		 444 aa  270  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.360795  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2033  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  38.26 
 
 		 491 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2571  diguanylate cyclase  36.86 
 
 		 452 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0240912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01027  predicted diguanylate cyclase  37.25 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1145  diguanylate cyclase  37.25 
 
 		 476 aa  252  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01034  hypothetical protein  37.25 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1143  diguanylate cyclase  37.25 
 
 		 476 aa  252  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.011762  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2617  diguanylate cyclase  37.25 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.885697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1267  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  37.25 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.413897 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1806  diguanylate cyclase  28.09 
 
 		 473 aa  152  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.782438  hitchhiker  0.00449211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3093  diguanylate cyclase  37.96 
 
 		 387 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2469  diguanylate cyclase  34.15 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  36.78 
 
 		 612 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0797  diguanylate cyclase  38.55 
 
 		 408 aa  123  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  31.33 
 
 		 510 aa  123  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  41.67 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  42.6 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  36.09 
 
 		 650 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2150  cellulose synthesis regulatory protein  40.85 
 
 		 570 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297138  normal  0.0131316 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1253  cellulose synthesis regulatory protein  40.85 
 
 		 570 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.839594 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1132  cellulose synthesis regulatory protein  40.85 
 
 		 570 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2146  cellulose synthesis regulatory protein  40.85 
 
 		 570 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.256949  normal  0.163286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2204  cellulose synthesis regulatory protein  40.85 
 
 		 570 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.315572  normal  0.912149 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3628  diguanylate cyclase  37.13 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0187  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.64 
 
 		 469 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  37.37 
 
 		 532 aa  120  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2153  membrane associated GGDEF protein  39.27 
 
 		 490 aa  120  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0694  diguanylate cyclase  33.51 
 
 		 536 aa  119  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00176  diguanylate cyclase  42.26 
 
 		 354 aa  120  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  35.86 
 
 		 532 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2546  diguanylate cyclase  35.53 
 
 		 564 aa  119  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0032266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39460  guanylyl cyclase  34.83 
 
 		 415 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.5 
 
 		 800 aa  119  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0426061  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  34.91 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0223  diguanylate cyclase  37.93 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.133267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  34.91 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2293  diguanylate cyclase  38.6 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000112238  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1693  diguanylate cyclase  34.01 
 
 		 564 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000442745  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  36.53 
 
 		 1000 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2732  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  34.01 
 
 		 564 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000132125  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1687  diguanylate cyclase  34.01 
 
 		 564 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0356503  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2297  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  43.64 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2970  diguanylate cyclase  40.24 
 
 		 557 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.853836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1230  diguanylate cyclase  34.01 
 
 		 558 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2544  diguanylate cyclase  38.69 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.871243  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2709  GGDEF domain-containing protein  34.48 
 
 		 411 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887365  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3092  diguanylate cyclase  36.55 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1682  diguanylate cyclase  28.19 
 
 		 560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  35.98 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  41.46 
 
 		 634 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1138  diguanylate cyclase  32.5 
 
 		 345 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2608  diguanylate cyclase  35.23 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.89 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3232  hypothetical protein  34.91 
 
 		 498 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0640076  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  39.76 
 
 		 554 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.29 
 
 		 415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2518  diguanylate cyclase  39.29 
 
 		 500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.784165 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2580  GGDEF domain-containing protein  41.72 
 
 		 1774 aa  117  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  38.32 
 
 		 611 aa  117  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0638  diguanylate cyclase  38.82 
 
 		 737 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  38.18 
 
 		 487 aa  117  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4680  diguanylate cyclase  36.67 
 
 		 405 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2680  diguanylate cyclase  35.4 
 
 		 252 aa  117  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2241  diguanylate cyclase  38.59 
 
 		 355 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3203  diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 569 aa  117  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0987619 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2523  diguanylate cyclase  35.98 
 
 		 587 aa  117  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2413  diguanylate cyclase  34.9 
 
 		 544 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0621  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 323 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.15 
 
 		 730 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2483  diguanylate cyclase  38.01 
 
 		 467 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1893  hypothetical protein  36.88 
 
 		 533 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0317418  normal  0.65749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3282  diguanylate cyclase  34.38 
 
 		 523 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2521  diguanylate cyclase  34.86 
 
 		 350 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1686  diguanylate cyclase  31.03 
 
 		 394 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.999235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2883  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.64 
 
 		 849 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483333  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3922  GGDEF domain-containing protein  36.47 
 
 		 364 aa  116  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0452  sensory box protein  41.46 
 
 		 451 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3549  diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2249  response regulator/GGDEF domain-containing protein  37.13 
 
 		 400 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2018  diguanylate cyclase  31.03 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6515  diguanylate cyclase  27.62 
 
 		 452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.683766  normal  0.600963 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0047  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.65 
 
 		 738 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4045  diguanylate cyclase  35.42 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4959  diguanylate cyclase  33.9 
 
 		 354 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.179086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1228  diguanylate cyclase  38.18 
 
 		 490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2673  diguanylate cyclase  34.5 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0734  GGDEF domain-containing protein  35.56 
 
 		 604 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4163  diguanylate cyclase  35.42 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1077  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  33.5 
 
 		 558 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  34.54 
 
 		 302 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0581  GGDEF domain-containing protein  41.55 
 
 		 625 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.916714  normal  0.0449396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0528  diguanylate cyclase  34.66 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0197143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>