More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01742 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01754  predicted diguanylate cyclase  100 
 
 
491 aa  994    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1857  diguanylate cyclase  99.8 
 
 
491 aa  992    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00173388  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2009  diguanylate cyclase  99.59 
 
 
491 aa  988    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2033  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  99.19 
 
 
491 aa  984    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1871  diguanylate cyclase  99.59 
 
 
491 aa  990    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0774935  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01742  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  994    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2509  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  99.77 
 
 
444 aa  900    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.360795  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1406  diguanylate cyclase  99.32 
 
 
444 aa  897    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1847  diguanylate cyclase  100 
 
 
491 aa  994    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.02251 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1267  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  37.86 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.413897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01027  predicted diguanylate cyclase  37.42 
 
 
452 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01034  hypothetical protein  37.42 
 
 
452 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1145  diguanylate cyclase  37.42 
 
 
476 aa  302  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1143  diguanylate cyclase  37.42 
 
 
476 aa  302  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.011762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2571  diguanylate cyclase  37.42 
 
 
452 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0240912 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2617  diguanylate cyclase  37.42 
 
 
452 aa  297  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.885697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0835  diguanylate cyclase  38.88 
 
 
443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1806  diguanylate cyclase  28.13 
 
 
473 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.782438  hitchhiker  0.00449211 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  34.22 
 
 
487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0796  diguanylate cyclase  31.91 
 
 
361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.121691  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  39.51 
 
 
532 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1851  diguanylate cyclase  38.46 
 
 
620 aa  109  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0528  diguanylate cyclase  36.72 
 
 
354 aa  108  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4518  diguanylate cyclase  34.66 
 
 
345 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2970  diguanylate cyclase  37.21 
 
 
557 aa  107  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.853836 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3922  GGDEF domain-containing protein  36.2 
 
 
364 aa  107  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1387  cyclic nucleotide-binding protein  33.75 
 
 
320 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243824  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2521  diguanylate cyclase  35.16 
 
 
350 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2425  diguanylate cyclase  35.4 
 
 
353 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  31.52 
 
 
510 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.98 
 
 
772 aa  104  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2636  diguanylate cyclase  33.86 
 
 
220 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128146  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0504  GGDEF domain-containing protein  38.55 
 
 
385 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3474  diguanylate cyclase  32.78 
 
 
393 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3631  diguanylate cyclase  31.15 
 
 
628 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1405  diguanylate cyclase  28.42 
 
 
464 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4959  diguanylate cyclase  34.46 
 
 
354 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.179086  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1808  diguanylate cyclase  30.21 
 
 
247 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148862  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4965  diguanylate cyclase  34.46 
 
 
308 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00367568  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4907  diguanylate cyclase  34.46 
 
 
308 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0301785  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4872  diguanylate cyclase  34.46 
 
 
308 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000065621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26970  hypothetical protein  38.24 
 
 
525 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  38.65 
 
 
532 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2249  response regulator/GGDEF domain-containing protein  33.7 
 
 
400 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  31.63 
 
 
532 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  32.76 
 
 
1774 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.63 
 
 
531 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3628  diguanylate cyclase  35.08 
 
 
388 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4245  GGDEF domain-containing protein  35.71 
 
 
477 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4804  diguanylate cyclase  34.46 
 
 
304 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0452209  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1319  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.48 
 
 
610 aa  101  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.104887  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  36.47 
 
 
714 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3178  diguanylate cyclase  24.12 
 
 
452 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0366604  hitchhiker  0.0000463802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3998  diguanylate cyclase  33.7 
 
 
591 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1136  diguanylate cyclase  34.52 
 
 
582 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  37.84 
 
 
493 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2284  hypothetical protein  37.79 
 
 
525 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0619167  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  33.82 
 
 
1000 aa  100  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4599  diguanylate cyclase  35.63 
 
 
231 aa  100  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.711309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  37.2 
 
 
294 aa  99.8  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  38.32 
 
 
548 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3160  diguanylate cyclase  24.17 
 
 
452 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.413104  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  36.07 
 
 
1037 aa  99.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  37.3 
 
 
493 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1491  diguanylate cyclase  33.74 
 
 
562 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430715  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2546  diguanylate cyclase  24.17 
 
 
452 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192419  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.36 
 
 
461 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3227  diguanylate cyclase  38.42 
 
 
359 aa  99.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.709302  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0241  diguanylate cyclase  36.2 
 
 
640 aa  99  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1325  sensory box protein  35.26 
 
 
428 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4161  diguanylate cyclase  33.92 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0470  GGDEF  33.51 
 
 
412 aa  99  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.57 
 
 
704 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0413  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.26 
 
 
461 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00466  Putative two-component system regulatory protein with GGDEF domain  36.36 
 
 
414 aa  99  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.6149  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.9 
 
 
317 aa  99  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2758  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.09 
 
 
698 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2337  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.26 
 
 
461 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114554  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1834  diguanylate cyclase  35.59 
 
 
525 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.245567  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1821  diguanylate cyclase  31.52 
 
 
466 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1891  diguanylate cyclase  31.52 
 
 
466 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.311116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0112  diguanylate cyclase  30.68 
 
 
361 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0231042 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.71 
 
 
301 aa  97.8  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03006  hypothetical protein  37.18 
 
 
520 aa  97.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4395  diguanylate cyclase  35.54 
 
 
498 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.48 
 
 
457 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  36.69 
 
 
374 aa  97.4  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3968  diguanylate cyclase  34.94 
 
 
385 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1730  diguanylate cyclase  30.89 
 
 
407 aa  97.1  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000615882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3979  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.9 
 
 
567 aa  97.4  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000058301  hitchhiker  0.000000371669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  34.76 
 
 
565 aa  97.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0645  diguanylate cyclase  34.66 
 
 
357 aa  97.1  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.588566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.57 
 
 
713 aa  97.1  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0797  diguanylate cyclase  35.59 
 
 
408 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71948  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3512  diguanylate cyclase  32.64 
 
 
318 aa  97.1  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  31.03 
 
 
609 aa  96.7  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1840  putative transmembrane transcriptional sensor regulator  32.81 
 
 
506 aa  96.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0399375  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1864  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.12 
 
 
457 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  0.121309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0443  diguanylate cyclase  34.27 
 
 
378 aa  96.7  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0452  sensory box protein  35.8 
 
 
451 aa  96.7  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>