More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1686 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1686  diguanylate cyclase  100 
 
 		 394 aa  799    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.999235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2018  diguanylate cyclase  99.48 
 
 		 386 aa  781    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  46.75 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1056  diguanylate cyclase  47.7 
 
 		 580 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.77678  normal  0.689214 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1148  diguanylate cyclase  39.81 
 
 		 634 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0203006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2966  diguanylate cyclase  41.8 
 
 		 386 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  decreased coverage  0.00586824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2608  diguanylate cyclase  31.96 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3546  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.09 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0176083 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  40.46 
 
 		 611 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0379  diguanylate cyclase  41.52 
 
 		 540 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2636  diguanylate cyclase  40.21 
 
 		 220 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  32.98 
 
 		 455 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1405  diguanylate cyclase  39.29 
 
 		 464 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2989  response regulator receiver protein  43.02 
 
 		 577 aa  133  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2920  sensor diguanylate cyclase  44.44 
 
 		 623 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.75 
 
 		 309 aa  132  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  39.66 
 
 		 532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2940  sensor diguanylate cyclase  39.53 
 
 		 571 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0162  diguanylate cyclase  35.57 
 
 		 614 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.62 
 
 		 505 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3308  diguanylate cyclase  39.18 
 
 		 603 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000660005  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1426  diguanylate cyclase  39.8 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1081  diguanylate cyclase  44.19 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  40.37 
 
 		 532 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2680  diguanylate cyclase  39.13 
 
 		 252 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3851  diguanylate cyclase  35.38 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3621  GGDEF  39.33 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0388472 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1328  diguanylate cyclase  39.16 
 
 		 564 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0263917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  36.71 
 
 		 513 aa  129  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02241  hypothetical protein  40.12 
 
 		 320 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  37.31 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  41.52 
 
 		 609 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0835  diguanylate cyclase  31.03 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153525  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6727  diguanylate cyclase  41.28 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0233  diguanylate cyclase  32.11 
 
 		 373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  41.52 
 
 		 709 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.64 
 
 		 634 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3093  diguanylate cyclase  37.37 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  44.44 
 
 		 624 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  30.53 
 
 		 457 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1125  GGDEF  42.47 
 
 		 509 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394023  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0452  diguanylate cyclase  40.76 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  38.33 
 
 		 565 aa  126  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1880  diguanylate cyclase  35.03 
 
 		 477 aa  126  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0268707  normal  0.0491745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3168  diguanylate cyclase  43.79 
 
 		 362 aa  126  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4122  diguanylate cyclase  44.31 
 
 		 395 aa  126  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.519011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2699  diguanylate cyclase  39.61 
 
 		 251 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3480  diguanylate cyclase  44.31 
 
 		 395 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232889  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0241  diguanylate cyclase  33.5 
 
 		 640 aa  126  8.000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1387  cyclic nucleotide-binding protein  41.67 
 
 		 320 aa  126  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0265  diguanylate cyclase  42.2 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.39 
 
 		 632 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  30.79 
 
 		 457 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3628  diguanylate cyclase  35.59 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3185  diguanylate cyclase  37.81 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.0939676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3646  diguanylate cyclase  41.99 
 
 		 357 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1170  hypothetical protein  38.95 
 
 		 768 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1176  hypothetical protein  38.95 
 
 		 768 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  38.15 
 
 		 949 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  38.95 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0130  diguanylate cyclase  43.35 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922006  normal  0.941747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6286  GGDEF domain-containing protein  44.77 
 
 		 668 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  42.42 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3863  diguanylate cyclase  36.42 
 
 		 426 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  42.11 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.13 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0604  diguanylate cyclase  40.31 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.436873  normal  0.310553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  40.78 
 
 		 631 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4283  diguanylate cyclase  35.35 
 
 		 480 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1808  diguanylate cyclase  40.46 
 
 		 247 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3563  diguanylate cyclase  42.11 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178663  normal  0.195496 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  47.59 
 
 		 417 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2801  diguanylate cyclase  41.67 
 
 		 628 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.615763  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1821  diguanylate cyclase  42.61 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.017871  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1122  GGDEF domain-containing protein  42.38 
 
 		 506 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.014859  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3232  hypothetical protein  38.42 
 
 		 498 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0640076  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2404  diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 479 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00227226  normal  0.966476 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.25 
 
 		 730 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0613  diguanylate cyclase  40.36 
 
 		 611 aa  123  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1272  diguanylate cyclase  41.76 
 
 		 632 aa  123  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0623275  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2709  GGDEF domain-containing protein  33.44 
 
 		 411 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887365  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.64 
 
 		 407 aa  123  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2195  diguanylate cyclase  40.23 
 
 		 496 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.741232  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3922  GGDEF domain-containing protein  34.48 
 
 		 364 aa  123  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03006  hypothetical protein  38.6 
 
 		 520 aa  123  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4776  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 403 aa  123  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0457  diguanylate cyclase  42.13 
 
 		 472 aa  123  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.562676 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  45.14 
 
 		 555 aa  123  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  42.2 
 
 		 764 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1138  diguanylate cyclase  38.07 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  42.2 
 
 		 764 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  42.44 
 
 		 1000 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4589  diguanylate cyclase  41.24 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1546  diguanylate cyclase  38.33 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0539589  hitchhiker  0.00796281 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  39.08 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3218  diguanylate cyclase  41.34 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1907  diguanylate cyclase  39.04 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230991 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3152  diguanylate cyclase  39.51 
 
 		 653 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000175722  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  40.85 
 
 		 732 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  43.68 
 
 		 764 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>