More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3152 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3152  diguanylate cyclase  100 
 
 
653 aa  1338    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000175722  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  43.14 
 
 
513 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0241  diguanylate cyclase  34.48 
 
 
640 aa  372  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1484  diguanylate cyclase  32.34 
 
 
615 aa  339  8e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3308  diguanylate cyclase  33.41 
 
 
603 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000660005  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1148  diguanylate cyclase  37.57 
 
 
634 aa  220  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0203006  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.96 
 
 
415 aa  174  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  39.01 
 
 
609 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  39.01 
 
 
709 aa  161  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.65 
 
 
675 aa  155  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  45.66 
 
 
494 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  45.09 
 
 
494 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  37.15 
 
 
1099 aa  152  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2477  hypothetical protein  44.25 
 
 
273 aa  146  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2333  hypothetical protein  43.68 
 
 
565 aa  145  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  42.54 
 
 
563 aa  144  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4930  diguanylate cyclase  41.28 
 
 
530 aa  143  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  42.13 
 
 
721 aa  140  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  32.74 
 
 
758 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  39.35 
 
 
764 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  39.44 
 
 
1079 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  39.79 
 
 
638 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  40.39 
 
 
466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3227  diguanylate cyclase  41.67 
 
 
359 aa  137  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.709302  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  44.97 
 
 
457 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  43.09 
 
 
764 aa  137  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.88 
 
 
505 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  43.09 
 
 
764 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1325  sensory box protein  39.77 
 
 
428 aa  136  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.34 
 
 
553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000172296  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  43.96 
 
 
457 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.44 
 
 
469 aa  134  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2290  diguanylate cyclase  42.46 
 
 
646 aa  134  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.666302 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  36.77 
 
 
608 aa  134  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0402  diguanylate cyclase  42.22 
 
 
866 aa  134  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362695  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  41.8 
 
 
455 aa  134  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  32.65 
 
 
356 aa  134  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  38.98 
 
 
1826 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.63 
 
 
457 aa  133  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.36 
 
 
353 aa  133  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  37.27 
 
 
555 aa  133  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2425  diguanylate cyclase  39.19 
 
 
353 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  30.74 
 
 
663 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0085  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.01 
 
 
301 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.16 
 
 
668 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  41.81 
 
 
517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  32.65 
 
 
356 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.37 
 
 
916 aa  132  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.28 
 
 
668 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4748  diguanylate cyclase  42.08 
 
 
377 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  41.21 
 
 
457 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  36.55 
 
 
414 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2673  diguanylate cyclase  32.62 
 
 
411 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  40.66 
 
 
457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  40.66 
 
 
457 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2008  diguanylate cyclase  35.16 
 
 
574 aa  130  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3998  diguanylate cyclase  46.29 
 
 
591 aa  130  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  41.21 
 
 
457 aa  130  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.12 
 
 
713 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1689  diguanylate cyclase  35.32 
 
 
574 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  44.64 
 
 
498 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.22 
 
 
704 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  35.18 
 
 
342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1306  diguanylate cyclase  34.22 
 
 
615 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.550913  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  39.79 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1336  diguanylate cyclase  43.6 
 
 
495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474489  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  42.11 
 
 
461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1977  membrane associated GGDEF protein  37.21 
 
 
583 aa  128  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4119  diguanylate cyclase  45.09 
 
 
382 aa  128  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  40.61 
 
 
457 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  44.38 
 
 
498 aa  128  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.89 
 
 
355 aa  128  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1949  sensory box protein  40.22 
 
 
654 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3583  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.42 
 
 
322 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864033 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  42.26 
 
 
307 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4234  diguanylate cyclase  41.71 
 
 
539 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.256126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3910  diguanylate cyclase  39.58 
 
 
537 aa  127  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283041  normal  0.244259 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0379  diguanylate cyclase  40 
 
 
540 aa  127  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1319  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.85 
 
 
610 aa  127  9e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.104887  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1570  diguanylate cyclase  41.92 
 
 
516 aa  127  9e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  42.78 
 
 
459 aa  127  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1523  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.78 
 
 
472 aa  126  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.64 
 
 
772 aa  126  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.99 
 
 
947 aa  127  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  37.62 
 
 
374 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1405  diguanylate cyclase  43.85 
 
 
464 aa  126  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2237  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.11 
 
 
556 aa  126  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  45.09 
 
 
342 aa  126  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  33.33 
 
 
353 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1554  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.38 
 
 
419 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  39.68 
 
 
457 aa  126  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0676  diguanylate cyclase  40.1 
 
 
550 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260909  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1484  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.41 
 
 
555 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  38.12 
 
 
517 aa  126  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3370  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.87 
 
 
860 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.742202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2748  diguanylate cyclase  40.91 
 
 
651 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0199433  hitchhiker  0.0067097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2709  GGDEF domain-containing protein  33.61 
 
 
411 aa  126  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887365  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  41.27 
 
 
457 aa  125  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.43 
 
 
901 aa  125  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1410  diguanylate cyclase  39.58 
 
 
497 aa  125  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>