More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2454 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  44.54 
 
 		 1139 aa  835    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  39.29 
 
 		 1147 aa  672    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1024 aa  2084    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 1188 aa  522  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 1026 aa  519  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  33.69 
 
 		 1146 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 		 1130 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 		 1217 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1164 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 		 1019 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  34.63 
 
 		 1100 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  35.72 
 
 		 1026 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1013 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1031 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 1168 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1064 aa  484  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1077 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1045 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1104 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1127 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1124 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1181 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1155 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1075 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 1190 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1020 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 1036 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  31.56 
 
 		 1095 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1161 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1177 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1097 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 1037 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1138 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1131 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 1144 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1114 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1128 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1038 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.83 
 
 		 1076 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 1038 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 1177 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1036 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1079 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1076 aa  413  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1095 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1012 aa  408  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1148 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1047 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1142 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1082 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1079 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 1011 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1071 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1081 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1058 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 1189 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1117 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1006 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1066 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 1102 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 1045 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1164 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3773  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1120 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 1040 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1095 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 1128 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 989 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 994 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1046 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1051 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 982 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1060 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  30.44 
 
 		 1128 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 1033 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1064 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1075 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 1000 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 1056 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 1029 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 1062 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 		 1116 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1147 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1013 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 1050 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1029 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1010 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  30.96 
 
 		 1043 aa  378  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1202 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1192 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 1175 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1122 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1042 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1008 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1148 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 1144 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 1004 aa  375  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1036 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1006 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 1052 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1076 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>