More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01815 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 927 aa  1867    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  38.14 
 
 		 922 aa  536  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1988  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1003 aa  264  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485528  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 957 aa  258  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 933 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 924 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 957 aa  193  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0637  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 916 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0978738  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 1051 aa  191  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3580  TonB-dependent receptor, plug  23.62 
 
 		 894 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553281  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03436  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 856 aa  177  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3993  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 897 aa  175  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.494791  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0313  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 897 aa  174  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2575  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 897 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.118608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 1090 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2438  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 892 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 938 aa  158  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3857  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1077 aa  154  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1056  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 888 aa  152  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0268559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 917 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 920 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0379  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 888 aa  139  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0418446  normal  0.660962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  23.64 
 
 		 919 aa  135  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 946 aa  135  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 962 aa  134  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 1001 aa  127  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 962 aa  125  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 972 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  22.39 
 
 		 932 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 931 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 991 aa  111  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 1004 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 943 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 853 aa  83.2  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1147 aa  80.9  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00302  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 746 aa  80.9  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0777336  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  39.45 
 
 		 1089 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1066 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 935 aa  79  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1493  outer membrane protein  38.89 
 
 		 929 aa  75.5  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.684854  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 961 aa  74.3  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 779 aa  74.3  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 897 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 958 aa  73.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 917 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 1008 aa  72.4  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 901 aa  72.8  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 866 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1075 aa  71.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  30.8 
 
 		 1005 aa  71.6  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 882 aa  71.6  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 936 aa  71.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 735 aa  71.2  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 809 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  26.71 
 
 		 838 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 988 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  30.24 
 
 		 828 aa  70.1  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  38.61 
 
 		 966 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  33.14 
 
 		 1010 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 777 aa  70.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  21.12 
 
 		 817 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 989 aa  70.1  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 828 aa  70.1  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3426  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 902 aa  70.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0666258  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 1003 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 1087 aa  68.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  28.27 
 
 		 942 aa  68.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  28.81 
 
 		 1095 aa  68.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 971 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 814 aa  68.9  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1079 aa  68.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  32.06 
 
 		 782 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 757 aa  67.4  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1094 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 952 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  37.61 
 
 		 1038 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 793 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 915 aa  66.6  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  27.52 
 
 		 972 aa  67  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1036 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 1144 aa  66.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  33.06 
 
 		 856 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1004 aa  66.2  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1062 aa  66.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 836 aa  66.2  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 935 aa  65.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 1071 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1076 aa  65.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 807 aa  65.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  29.61 
 
 		 767 aa  65.1  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1011 aa  65.1  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 833 aa  65.1  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 944 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  27.8 
 
 		 1028 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 933 aa  64.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 791 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1019 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 1008 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 1050 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>