294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2453 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 540 aa  1113    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  46.47 
 
 		 550 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  34.75 
 
 		 611 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  31.19 
 
 		 576 aa  219  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  31.06 
 
 		 576 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  31.94 
 
 		 579 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  32.28 
 
 		 531 aa  201  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  31.27 
 
 		 576 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  31.7 
 
 		 531 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  29.56 
 
 		 588 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 596 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 557 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  29.17 
 
 		 549 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 571 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 590 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  29.66 
 
 		 577 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 529 aa  161  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 548 aa  159  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  30.84 
 
 		 564 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 606 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 565 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  29.07 
 
 		 540 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  29.9 
 
 		 527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 582 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  31.31 
 
 		 505 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  29.13 
 
 		 584 aa  143  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 568 aa  140  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 582 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 589 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 557 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 602 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 476 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 506 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  29.79 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  31.42 
 
 		 568 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 600 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 620 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 583 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 636 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.99 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  27.52 
 
 		 666 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 599 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 566 aa  120  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 594 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 629 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 593 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  26.31 
 
 		 579 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  32.23 
 
 		 561 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 528 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 581 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 507 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4138  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 612 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.37111  normal  0.50692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 642 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  25.33 
 
 		 614 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 626 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 484 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 477 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 499 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 478 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.61 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 479 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.73 
 
 		 508 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 486 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 623 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25.79 
 
 		 494 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 559 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 541 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 601 aa  100  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  25.99 
 
 		 639 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  24.15 
 
 		 504 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 494 aa  100  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 481 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  23.5 
 
 		 511 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 		 519 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 615 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 497 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 485 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 499 aa  97.1  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 587 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 531 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  23.83 
 
 		 498 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 511 aa  95.9  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 595 aa  95.5  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  24.33 
 
 		 617 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  25.13 
 
 		 506 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.39 
 
 		 511 aa  94.7  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 527 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 534 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 631 aa  94  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 523 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  29.59 
 
 		 555 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>