99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5686 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5686  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 427 aa  830    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  36.69 
 
 		 556 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  37.12 
 
 		 555 aa  189  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  37.92 
 
 		 545 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  36.96 
 
 		 548 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  29.83 
 
 		 551 aa  127  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 582 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 538 aa  86.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  27.16 
 
 		 586 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  27.41 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0360  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 		 589 aa  67.8  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  25.75 
 
 		 485 aa  67  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  27.15 
 
 		 561 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  33.59 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  36.43 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28080  predicted transcriptional regulator with HTH domain  29.61 
 
 		 582 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  27.31 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  33.59 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  35.09 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  33.33 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  23.81 
 
 		 687 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  31.16 
 
 		 448 aa  59.7  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  29.56 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  37.78 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  33.08 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  34.04 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  36.94 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  24.69 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  29.92 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  39.56 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  34.82 
 
 		 358 aa  57  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 606 aa  57  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  31.66 
 
 		 448 aa  57  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  27.74 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0004  putative transcriptional regulator  28.96 
 
 		 568 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  37.5 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  39.13 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 634 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  39.51 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  30.71 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0641  putative transcriptional regulator  31.06 
 
 		 207 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2730  putative ATP-dependent DNA helicase  25.63 
 
 		 552 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  34.76 
 
 		 456 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  28.67 
 
 		 483 aa  53.9  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  26.24 
 
 		 500 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  31.2 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7034  hypothetical cytosolic protein  31.76 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0094  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 		 572 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.130495  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  22.13 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  29.69 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 484 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  23.02 
 
 		 622 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  30.66 
 
 		 581 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  26.38 
 
 		 526 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 413 aa  51.2  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  26.38 
 
 		 522 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 469 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  26.64 
 
 		 508 aa  50.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  29.36 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4679  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 		 478 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  29.36 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  23.16 
 
 		 611 aa  50.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0416  putative transcriptional regulator  22.01 
 
 		 560 aa  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.563354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 494 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  26.74 
 
 		 515 aa  49.7  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  20.57 
 
 		 311 aa  49.7  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  27.92 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 226 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  32.69 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  32.29 
 
 		 564 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 		 641 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  26.64 
 
 		 509 aa  46.6  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  34.44 
 
 		 454 aa  46.6  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  27.62 
 
 		 572 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  32.22 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3662  putative transcriptional regulator  24.15 
 
 		 554 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2269  putative transcriptional regulator  24.46 
 
 		 556 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.856074  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  23.12 
 
 		 314 aa  46.2  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 		 498 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  24.35 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  24.9 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3059  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 599 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  33.71 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 483 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  23.98 
 
 		 483 aa  43.9  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 628 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  29.83 
 
 		 479 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 448 aa  43.5  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 472 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1492 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>