More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3251 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  100 
 
 
1128 aa  2282    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  40.86 
 
 
1130 aa  770    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  37.99 
 
 
1040 aa  626  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 
1026 aa  575  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 
1139 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 
1114 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 
1116 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 
1177 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 
1155 aa  533  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  35.22 
 
 
1005 aa  524  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 
1175 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  34.55 
 
 
1023 aa  519  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 
1124 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  35.84 
 
 
1164 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 
1037 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  34.81 
 
 
1008 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 
1128 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 
1148 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  33.25 
 
 
1179 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 
1085 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 
1036 aa  509  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 
1029 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 
1064 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 
1161 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 
1020 aa  506  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 
1049 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 
1189 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 
1066 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 
1082 aa  502  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 
1097 aa  503  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 
1117 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  35.5 
 
 
1012 aa  497  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 
1202 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  35.15 
 
 
989 aa  496  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 
982 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 
1047 aa  490  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  32.67 
 
 
1063 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 
1192 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 
1127 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  34.31 
 
 
986 aa  492  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  34.55 
 
 
1002 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 
1000 aa  487  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 
1172 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 
1060 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 
1116 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 
1052 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 
1033 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 
1038 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 
1161 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  35.13 
 
 
1083 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  34.2 
 
 
1043 aa  476  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 
1181 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 
1084 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 
1150 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 
1132 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 
1173 aa  475  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 
1006 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 
1122 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 
1050 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 
1137 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 
1138 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 
1062 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 
1177 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 
1011 aa  464  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 
1006 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 
996 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 
1041 aa  459  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 
994 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 
1152 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 
1119 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 
1077 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 
1079 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 
1154 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 
1039 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 
1026 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 
1131 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 
1090 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 
1034 aa  448  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 
1039 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 
1017 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 
1071 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 
1010 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 
1168 aa  443  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 
1103 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 
1164 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 
1129 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 
1146 aa  436  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 
1071 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 
1036 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 
1004 aa  432  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 
1051 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 
1023 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 
1081 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 
1077 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 
1060 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 
1065 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 
1163 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 
1003 aa  424  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 
1010 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 
1142 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>