103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1721 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  100 
 
 		 168 aa  333  7e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0628  putative conjugal transfer protein TraF  44.59 
 
 		 220 aa  123  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0684  conjugal transfer protein precursor  40.96 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2342  conjugal transfer protein precursor  40.51 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1819  plasmid transfer protein TraF  38.51 
 
 		 192 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2658  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  35.15 
 
 		 199 aa  96.3  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1862 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31080  putative conjugal transfer protein  38.67 
 
 		 191 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000439083  unclonable  1.40338e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35940  conjugative transfer signal peptidase TraF  34.55 
 
 		 174 aa  94  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7735  putative conjugal transfer protein precursor  32.93 
 
 		 181 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1292  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  37.28 
 
 		 199 aa  91.7  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1258  TraF peptidase  37.13 
 
 		 195 aa  91.3  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0362  conjugal transfer protein precursor  38.24 
 
 		 192 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0849  conjugal transfer protein precursor  35.19 
 
 		 186 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0756  putative conjugal transfer protein precursor  34.55 
 
 		 181 aa  88.2  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2802  conjugal transfer protein precursor  32.93 
 
 		 181 aa  87.4  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0454  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  35.93 
 
 		 195 aa  87.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1988  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  32.95 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3189  conjugal transfer protein precursor  34.15 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.110691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1882  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  35.33 
 
 		 199 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.760081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3011  conjugal transfer protein precursor  32.93 
 
 		 181 aa  85.5  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2015  conjugal transfer protein TraF  33.12 
 
 		 173 aa  84.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.494735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3373  conjugal transfer protein precursor  33.33 
 
 		 188 aa  84  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1267  TraF peptidase  33.33 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3556  conjugal transfer protein precursor  31.71 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3183  conjugal transfer protein precursor  33.77 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0706  conjugal transfer protein precursor  33.12 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0136  hypothetical protein  32.91 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3727  conjugal transfer protein  33.54 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2333  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  33.55 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3080  conjugal transfer protein precursor  34.59 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2356  conjugal transfer protein TraF  37.68 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3349  putative conjugal transfer protein (traF)  35.97 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.920518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3685  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  34.51 
 
 		 192 aa  80.5  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0585  conjugal transfer protein precursor  33.33 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.961115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2624  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  35.93 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0317965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3521  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  35.33 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2602  conjugal transfer TraF transmembrane protein  34.18 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1030  putative conjugal transfer protein TraF  34.94 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.201544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7435  putative conjugal transfer protein precursor  31.85 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1488  TraF peptidase  35.33 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2622  conjugal transfer protein traF  30.36 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4011  peptidase S26C conjugative transfer signal peptidase TraF  33.99 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0978  putative conjugal transfer protein TraF  34.44 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3020  TraF peptidase  34.73 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3845  TraF peptidase  31.48 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2717  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  34.73 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.378088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2493  conjugal transfer protein traF  29.7 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.955009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0519  TraF peptidase  35 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19802  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5335  conjugal transfer protein TraF  35.51 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2929  TraF peptidase  35.33 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5167  putative conjugal transfer protein  35.46 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3906  conjugal transfer protein precursor  34.39 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2871  putative conjugal transfer protein precursor  30.49 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3821  putative conjugal transfer protein precursor  30.49 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1510  conjugal transfer protein precursor  31.21 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0690  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  32.91 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1605  conjugal transfer protein precursor  32.12 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2333  TraF peptidase  31.08 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.530383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2250  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  35.29 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0182  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  32.35 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4170  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  33.96 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2090  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  31.43 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1200  conjugal transfer protein precursor  29.27 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3535  conjugal transfer protein precursor  29.27 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9596  conjugal transfer pilin processing protease TraF  34.53 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0024  conjugal transfer peptidase TraF  30.07 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0928495  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8132  conjugal transfer pilin processing protease TraF  34.93 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.562058  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5513  conjugal transfer pilin processing protease TraF  34.18 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0619893 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1613  Peptidase S26, conserved region  32.52 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9191  conjugal transfer pilin processing protease TraF  31.14 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  26.75 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  33.64 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5392  conjugal transfer pilin processing protease TraF  30.64 
 
 		 188 aa  47.4  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4318  conjugal transfer peptidase TraF  30.77 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.666269  normal  0.975126 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4714  conjugative transfer signal peptidase TraF  30.67 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1416  conjugal transfer protein precursor  25 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1726  conjugal transfer protein TraF, putative  24.39 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4541  conjugal transfer pilin processing protease TraF  30.82 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.708935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0308  type IV secretory protease  23.42 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  31.15 
 
 		 285 aa  45.4  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  30.97 
 
 		 199 aa  44.7  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  29.75 
 
 		 262 aa  44.3  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2247  conjugal transfer peptidase TraF  27.59 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  32.17 
 
 		 214 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  30.36 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0246  type IV secretory protease  25.87 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0373  putative pilus assembly protein, TrhF  32.93 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  30.17 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0913  signal peptidase I  28.86 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0872445  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  30.17 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1172  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  23.81 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  31.53 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  32.81 
 
 		 264 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0276  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  23.31 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0878  hypothetical protein  24.29 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3769  type IV secretory protease  24.24 
 
 		 128 aa  42  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2079  thylakoidal processing peptidase  35.37 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3710  signal peptidase I  28.35 
 
 		 272 aa  41.2  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  36.36 
 
 		 215 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  26.62 
 
 		 222 aa  41.2  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>