97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1605 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1605  conjugal transfer protein precursor  100 
 
 		 201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3011  conjugal transfer protein precursor  70.06 
 
 		 181 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3080  conjugal transfer protein precursor  66.67 
 
 		 181 aa  240  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2333  TraF peptidase  65.54 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.530383  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0585  conjugal transfer protein precursor  63.84 
 
 		 181 aa  232  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.961115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4011  peptidase S26C conjugative transfer signal peptidase TraF  63.28 
 
 		 181 aa  228  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2871  putative conjugal transfer protein precursor  63.07 
 
 		 181 aa  223  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0756  putative conjugal transfer protein precursor  61.02 
 
 		 181 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7735  putative conjugal transfer protein precursor  59.32 
 
 		 181 aa  213  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3189  conjugal transfer protein precursor  59.66 
 
 		 181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.110691  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3821  putative conjugal transfer protein precursor  57.95 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1510  conjugal transfer protein precursor  56.5 
 
 		 180 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0519  TraF peptidase  58.19 
 
 		 181 aa  204  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19802  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3556  conjugal transfer protein precursor  55.93 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1030  putative conjugal transfer protein TraF  57.58 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.201544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1200  conjugal transfer protein precursor  53.67 
 
 		 181 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3535  conjugal transfer protein precursor  53.67 
 
 		 181 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2802  conjugal transfer protein precursor  55.37 
 
 		 181 aa  191  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0136  hypothetical protein  55.49 
 
 		 310 aa  187  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3183  conjugal transfer protein precursor  60.13 
 
 		 200 aa  187  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3373  conjugal transfer protein precursor  56.07 
 
 		 188 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7435  putative conjugal transfer protein precursor  54.72 
 
 		 163 aa  175  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3349  putative conjugal transfer protein (traF)  54.09 
 
 		 171 aa  175  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.920518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0978  putative conjugal transfer protein TraF  52.1 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3906  conjugal transfer protein precursor  50.62 
 
 		 171 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3845  TraF peptidase  49.66 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232277  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0706  conjugal transfer protein precursor  55.1 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2493  conjugal transfer protein traF  47.09 
 
 		 196 aa  154  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.955009 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3685  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  50.29 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2622  conjugal transfer protein traF  51.9 
 
 		 199 aa  151  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0362  conjugal transfer protein precursor  47.02 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0182  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  48.94 
 
 		 147 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0849  conjugal transfer protein precursor  46.43 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2015  conjugal transfer protein TraF  40.62 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.494735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31080  putative conjugal transfer protein  41.36 
 
 		 191 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000439083  unclonable  1.40338e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35940  conjugative transfer signal peptidase TraF  39.08 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1258  TraF peptidase  38.82 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2250  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  48.92 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1292  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  38.24 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1882  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  37.65 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.760081  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2090  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  37.72 
 
 		 177 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2658  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  38.24 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1819  plasmid transfer protein TraF  37.84 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3521  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  37.06 
 
 		 195 aa  92  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1988  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  37.97 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3727  conjugal transfer protein  38.55 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1267  TraF peptidase  32.39 
 
 		 195 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2624  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  38.31 
 
 		 195 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0317965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2333  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  37.27 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0454  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  34.09 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2929  TraF peptidase  35.26 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1488  TraF peptidase  36.47 
 
 		 195 aa  84.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4170  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  36.99 
 
 		 183 aa  84.7  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2602  conjugal transfer TraF transmembrane protein  37.35 
 
 		 199 aa  84.7  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0690  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  36.63 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5335  conjugal transfer protein TraF  31.91 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2717  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  35.29 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.378088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3020  TraF peptidase  35.29 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7065  conjugal transfer pilin processing protease TraF  39.73 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5167  putative conjugal transfer protein  33.1 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8132  conjugal transfer pilin processing protease TraF  38.46 
 
 		 176 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.562058  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2342  conjugal transfer protein precursor  28.08 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  32.12 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0684  conjugal transfer protein precursor  29.73 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2356  conjugal transfer protein TraF  29.41 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9191  conjugal transfer pilin processing protease TraF  36 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0628  putative conjugal transfer protein TraF  31.97 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1416  conjugal transfer protein precursor  32.43 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1726  conjugal transfer protein TraF, putative  32.43 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4714  conjugative transfer signal peptidase TraF  28.85 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0276  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  30.41 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4541  conjugal transfer pilin processing protease TraF  34.25 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.708935  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5392  conjugal transfer pilin processing protease TraF  35.37 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0024  conjugal transfer peptidase TraF  27.71 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0928495  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9596  conjugal transfer pilin processing protease TraF  35.86 
 
 		 177 aa  52  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  33.04 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4318  conjugal transfer peptidase TraF  29.8 
 
 		 178 aa  48.1  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.666269  normal  0.975126 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5513  conjugal transfer pilin processing protease TraF  31.97 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0619893 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  30.91 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0878  hypothetical protein  21.85 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1613  Peptidase S26, conserved region  27.65 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1172  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  21.19 
 
 		 155 aa  45.4  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  26.96 
 
 		 178 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6803  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  34.96 
 
 		 169 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  25.5 
 
 		 322 aa  45.1  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2247  conjugal transfer peptidase TraF  26.09 
 
 		 178 aa  44.7  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3769  type IV secretory protease  33.73 
 
 		 128 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  27.68 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  31.4 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6613  conjugal transfer peptidase TraF  29.14 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  31.47 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6524  conjugal transfer peptidase TraF  29.14 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1523  signal peptidase I  29.07 
 
 		 178 aa  42  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000512014  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  23.78 
 
 		 325 aa  42  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2655  hypothetical protein  34.31 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.364147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  21.43 
 
 		 322 aa  41.6  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9241  predicted protein  25.44 
 
 		 178 aa  41.2  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>