78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1613 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1613  Peptidase S26, conserved region  100 
 
 		 177 aa  360  5.0000000000000005e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9596  conjugal transfer pilin processing protease TraF  37.99 
 
 		 177 aa  84.3  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4714  conjugative transfer signal peptidase TraF  33.73 
 
 		 162 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4541  conjugal transfer pilin processing protease TraF  33.15 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.708935  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4318  conjugal transfer peptidase TraF  36.36 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.666269  normal  0.975126 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0024  conjugal transfer peptidase TraF  31.67 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0928495  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5392  conjugal transfer pilin processing protease TraF  33.72 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9191  conjugal transfer pilin processing protease TraF  34.88 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5513  conjugal transfer pilin processing protease TraF  34.44 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0619893 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8132  conjugal transfer pilin processing protease TraF  34.44 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.562058  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2622  conjugal transfer protein traF  33.33 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7065  conjugal transfer pilin processing protease TraF  32.02 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6524  conjugal transfer peptidase TraF  35.9 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897542  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6613  conjugal transfer peptidase TraF  35.9 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2247  conjugal transfer peptidase TraF  28.26 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1819  plasmid transfer protein TraF  31.33 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2090  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  34.78 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2015  conjugal transfer protein TraF  33.33 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.494735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2250  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  32.89 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0182  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  32.21 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3727  conjugal transfer protein  32.12 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0756  putative conjugal transfer protein precursor  30.2 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0362  conjugal transfer protein precursor  33.33 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2493  conjugal transfer protein traF  31.87 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.955009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3845  TraF peptidase  27.07 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232277  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2333  TraF peptidase  29.24 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.530383  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2658  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  31.94 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3349  putative conjugal transfer protein (traF)  27.33 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.920518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31080  putative conjugal transfer protein  34.88 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000439083  unclonable  1.40338e-22 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  32.52 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2871  putative conjugal transfer protein precursor  29.61 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1292  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  35.67 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0519  TraF peptidase  29.14 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19802  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7735  putative conjugal transfer protein precursor  28.86 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0849  conjugal transfer protein precursor  25.41 
 
 		 186 aa  52  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4011  peptidase S26C conjugative transfer signal peptidase TraF  27.54 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4170  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  30.69 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3183  conjugal transfer protein precursor  31.71 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3080  conjugal transfer protein precursor  30.92 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35940  conjugative transfer signal peptidase TraF  33.9 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0684  conjugal transfer protein precursor  28.65 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0628  putative conjugal transfer protein TraF  27.54 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1030  putative conjugal transfer protein TraF  29.05 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.201544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0276  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  27.27 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3011  conjugal transfer protein precursor  27.63 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2531  conjugal transfer protein TraF  25.9 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400646  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3373  conjugal transfer protein precursor  30.07 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0706  conjugal transfer protein precursor  26.4 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2802  conjugal transfer protein precursor  28.31 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3521  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  35.48 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0136  hypothetical protein  31.36 
 
 		 310 aa  48.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3906  conjugal transfer protein precursor  26.11 
 
 		 171 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0690  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  32.12 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1258  TraF peptidase  33.76 
 
 		 195 aa  47.8  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1488  TraF peptidase  35.48 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2624  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  31.94 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0317965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2333  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  33.12 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2717  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  34.84 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.378088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2342  conjugal transfer protein precursor  28.19 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1605  conjugal transfer protein precursor  27.65 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1988  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  30.16 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3020  TraF peptidase  34.84 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3556  conjugal transfer protein precursor  27.27 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0454  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  31.85 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0585  conjugal transfer protein precursor  26.44 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.961115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5335  conjugal transfer protein TraF  30.07 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1510  conjugal transfer protein precursor  25.88 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2602  conjugal transfer TraF transmembrane protein  35.51 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7435  putative conjugal transfer protein precursor  26.35 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3685  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  29.05 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3821  putative conjugal transfer protein precursor  26.97 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3189  conjugal transfer protein precursor  26.67 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.110691  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1200  conjugal transfer protein precursor  26.14 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3535  conjugal transfer protein precursor  26.14 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1882  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  33.12 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.760081  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1267  TraF peptidase  29.84 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1416  conjugal transfer protein precursor  25.29 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1726  conjugal transfer protein TraF, putative  25.29 
 
 		 181 aa  40.8  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>