132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4714 on replicon NC_010000
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010000  Sbal195_4714  conjugative transfer signal peptidase TraF  100 
 
 		 162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5392  conjugal transfer pilin processing protease TraF  39.01 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8132  conjugal transfer pilin processing protease TraF  35.98 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.562058  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9191  conjugal transfer pilin processing protease TraF  34.97 
 
 		 176 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4541  conjugal transfer pilin processing protease TraF  31.48 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.708935  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7065  conjugal transfer pilin processing protease TraF  31.48 
 
 		 169 aa  91.3  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5513  conjugal transfer pilin processing protease TraF  31.17 
 
 		 188 aa  91.3  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0619893 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9596  conjugal transfer pilin processing protease TraF  34.75 
 
 		 177 aa  89  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0024  conjugal transfer peptidase TraF  33.54 
 
 		 174 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0928495  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2247  conjugal transfer peptidase TraF  31.29 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1613  Peptidase S26, conserved region  33.73 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4318  conjugal transfer peptidase TraF  32.21 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.666269  normal  0.975126 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6524  conjugal transfer peptidase TraF  32.89 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897542  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6613  conjugal transfer peptidase TraF  32.89 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0585  conjugal transfer protein precursor  35.42 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.961115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2531  conjugal transfer protein TraF  32.21 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400646  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3183  conjugal transfer protein precursor  30.25 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2015  conjugal transfer protein TraF  34.27 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.494735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2333  TraF peptidase  32.48 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.530383  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4011  peptidase S26C conjugative transfer signal peptidase TraF  31.25 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1605  conjugal transfer protein precursor  28.85 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1172  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  27.04 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7435  putative conjugal transfer protein precursor  31.25 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0756  putative conjugal transfer protein precursor  30.77 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2871  putative conjugal transfer protein precursor  30.07 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3349  putative conjugal transfer protein (traF)  30.82 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.920518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0849  conjugal transfer protein precursor  27.78 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3011  conjugal transfer protein precursor  34.72 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0362  conjugal transfer protein precursor  33.11 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3845  TraF peptidase  30.67 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232277  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1510  conjugal transfer protein precursor  34.03 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3373  conjugal transfer protein precursor  31.94 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  31.78 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3080  conjugal transfer protein precursor  32.41 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1030  putative conjugal transfer protein TraF  30.14 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.201544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0136  hypothetical protein  30.49 
 
 		 310 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7735  putative conjugal transfer protein precursor  31.97 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3685  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  29.25 
 
 		 192 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3189  conjugal transfer protein precursor  29.37 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.110691  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1200  conjugal transfer protein precursor  29.93 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3535  conjugal transfer protein precursor  29.93 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3821  putative conjugal transfer protein precursor  30.61 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0878  hypothetical protein  24.22 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  34.78 
 
 		 190 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0706  conjugal transfer protein precursor  27.97 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0519  TraF peptidase  30 
 
 		 181 aa  50.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19802  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5335  conjugal transfer protein TraF  28.86 
 
 		 179 aa  50.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2342  conjugal transfer protein precursor  25 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3196  signal peptidase I  33.03 
 
 		 436 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  30.83 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3906  conjugal transfer protein precursor  27.78 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1819  plasmid transfer protein TraF  31.51 
 
 		 192 aa  47.8  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  28.21 
 
 		 267 aa  47.4  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  32.98 
 
 		 304 aa  47.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2493  conjugal transfer protein traF  28.17 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.955009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  32.26 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  28.57 
 
 		 262 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1330  thylakoidal processing peptidase  35.11 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0182  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  29.66 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  30.67 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0978  putative conjugal transfer protein TraF  28.47 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  30.34 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  30 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  31.03 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  27.54 
 
 		 200 aa  45.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  29.03 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  32.14 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3556  conjugal transfer protein precursor  29.66 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2622  conjugal transfer protein traF  28.48 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  30.43 
 
 		 267 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  30 
 
 		 220 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  27.59 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1076  peptidase S26A, signal peptidase I  29.29 
 
 		 259 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  27.59 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10441  leader peptidase I  27.35 
 
 		 196 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2165  Type IV secretory pathway protease TraF-like  26.52 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2333  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  31.45 
 
 		 199 aa  44.7  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  32.53 
 
 		 190 aa  44.3  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  29.6 
 
 		 215 aa  44.3  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  32.18 
 
 		 222 aa  44.3  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  29.41 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0425  signal peptidase I  34.74 
 
 		 243 aa  43.9  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  30.25 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  34.12 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  28.05 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2079  thylakoidal processing peptidase  32.99 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  31.96 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  30.33 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2090  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  29.73 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  27.5 
 
 		 262 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2135  signal peptidase I  34.09 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0591499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0684  conjugal transfer protein precursor  26.39 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2802  conjugal transfer protein precursor  28.08 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  30.33 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  27.08 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  27.69 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1523  signal peptidase I  35.37 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000512014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  25 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5374  type IV secretory pathway protease TraF-like protein  27.65 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.705949 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  35.71 
 
 		 214 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000528092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>