91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2658 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2658  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  100 
 
 		 199 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1292  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  80.4 
 
 		 199 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35940  conjugative transfer signal peptidase TraF  87.93 
 
 		 174 aa  303  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3727  conjugal transfer protein  78.33 
 
 		 203 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1882  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  79.4 
 
 		 199 aa  293  9e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.760081  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1988  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  78.35 
 
 		 195 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2602  conjugal transfer TraF transmembrane protein  78.39 
 
 		 199 aa  290  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1258  TraF peptidase  77.39 
 
 		 195 aa  287  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0454  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  76.38 
 
 		 195 aa  286  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31080  putative conjugal transfer protein  76.38 
 
 		 191 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000439083  unclonable  1.40338e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0690  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  82.07 
 
 		 203 aa  275  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3020  TraF peptidase  74.87 
 
 		 195 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2717  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  74.87 
 
 		 195 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.378088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1267  TraF peptidase  71.5 
 
 		 195 aa  264  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1488  TraF peptidase  75.77 
 
 		 195 aa  263  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3521  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  73.37 
 
 		 195 aa  262  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2333  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  78.89 
 
 		 199 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2624  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  74.23 
 
 		 195 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0317965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2929  TraF peptidase  74.38 
 
 		 203 aa  250  8.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4170  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  68.31 
 
 		 183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2090  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  53.89 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2871  putative conjugal transfer protein precursor  44.52 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7735  putative conjugal transfer protein precursor  43.87 
 
 		 181 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3685  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  47.37 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2015  conjugal transfer protein TraF  44.38 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.494735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0362  conjugal transfer protein precursor  47.65 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3821  putative conjugal transfer protein precursor  42.04 
 
 		 181 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0519  TraF peptidase  44.52 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19802  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3011  conjugal transfer protein precursor  40.12 
 
 		 181 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0756  putative conjugal transfer protein precursor  40.76 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4011  peptidase S26C conjugative transfer signal peptidase TraF  41.92 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2493  conjugal transfer protein traF  45.35 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.955009 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1030  putative conjugal transfer protein TraF  41.67 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.201544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3080  conjugal transfer protein precursor  42.11 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0585  conjugal transfer protein precursor  40.72 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.961115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0849  conjugal transfer protein precursor  39.66 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3349  putative conjugal transfer protein (traF)  40.7 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.920518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0978  putative conjugal transfer protein TraF  41.62 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0182  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  46.36 
 
 		 147 aa  107  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0136  hypothetical protein  38.86 
 
 		 310 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2802  conjugal transfer protein precursor  41.56 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3906  conjugal transfer protein precursor  38.75 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3189  conjugal transfer protein precursor  38.29 
 
 		 181 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.110691  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1200  conjugal transfer protein precursor  40.26 
 
 		 181 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3535  conjugal transfer protein precursor  40.26 
 
 		 181 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3556  conjugal transfer protein precursor  41.61 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2333  TraF peptidase  37.5 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.530383  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2622  conjugal transfer protein traF  42.62 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1510  conjugal transfer protein precursor  37.29 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3183  conjugal transfer protein precursor  36.91 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1819  plasmid transfer protein TraF  35.08 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3845  TraF peptidase  38.95 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232277  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3373  conjugal transfer protein precursor  34.66 
 
 		 188 aa  98.2  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7435  putative conjugal transfer protein precursor  38.1 
 
 		 163 aa  98.2  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  35.15 
 
 		 168 aa  96.3  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1605  conjugal transfer protein precursor  38.24 
 
 		 201 aa  95.5  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0706  conjugal transfer protein precursor  36.24 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0684  conjugal transfer protein precursor  35.58 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2356  conjugal transfer protein TraF  34.04 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5335  conjugal transfer protein TraF  38.36 
 
 		 179 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2250  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  43.33 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5167  putative conjugal transfer protein  39.07 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2342  conjugal transfer protein precursor  32.39 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8132  conjugal transfer pilin processing protease TraF  34.86 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.562058  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0628  putative conjugal transfer protein TraF  32.89 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4318  conjugal transfer peptidase TraF  33.99 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.666269  normal  0.975126 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9596  conjugal transfer pilin processing protease TraF  35.85 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7065  conjugal transfer pilin processing protease TraF  32.89 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5392  conjugal transfer pilin processing protease TraF  35.14 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0024  conjugal transfer peptidase TraF  27.17 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0928495  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6524  conjugal transfer peptidase TraF  32.68 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897542  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6613  conjugal transfer peptidase TraF  32.68 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3710  signal peptidase I  31.09 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1613  Peptidase S26, conserved region  31.94 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4541  conjugal transfer pilin processing protease TraF  31.75 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.708935  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5513  conjugal transfer pilin processing protease TraF  34.67 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0619893 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9191  conjugal transfer pilin processing protease TraF  32.43 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0276  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  29.73 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1416  conjugal transfer protein precursor  29.11 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1726  conjugal transfer protein TraF, putative  28.48 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  35.29 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4209  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  27.54 
 
 		 168 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2531  conjugal transfer protein TraF  38.96 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400646  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6223  hypothetical protein  27.37 
 
 		 175 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2247  conjugal transfer peptidase TraF  30.19 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1111  signal peptidase I  40.24 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305344  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0373  putative pilus assembly protein, TrhF  31.33 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0184  signal peptidase I  30.65 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0913  signal peptidase I  33.93 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0872445  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  41.6  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  27.08 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>