126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0373 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0373  putative pilus assembly protein, TrhF  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6223  hypothetical protein  35.76 
 
 		 175 aa  84.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0097  type IV conjugative transfer system signal peptidase  30.77 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.120482 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4209  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  33.78 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1091  conjugation signal peptidase TraF, putative  28.38 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1533  hypothetical protein  30.56 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2655  hypothetical protein  34.88 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.364147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1267  TraF peptidase  36.9 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0937  putative type IV secretory protease  24.86 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.320644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2322  hypothetical protein  31.79 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0661618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0308  type IV secretory protease  24.05 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  31.01 
 
 		 158 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  31.14 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0246  type IV secretory protease  25.95 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  31.37 
 
 		 267 aa  51.2  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2929  TraF peptidase  33.33 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0454  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  33.33 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  24.68 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6803  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  31.88 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0684  conjugal transfer protein precursor  35.37 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  35.16 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  36.26 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  35.35 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  32.46 
 
 		 271 aa  48.5  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  35.48 
 
 		 226 aa  47.8  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  36.17 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  25.83 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  27.27 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  34.18 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  25.3 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  30.28 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3011  conjugal transfer protein precursor  32.14 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  34.41 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  30.91 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  31.58 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  31.58 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0553  signal peptidase IB  31.58 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1103  Signal peptidase I  26.89 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  32.26 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  35.16 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  31.31 
 
 		 263 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  36.26 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4170  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  27.38 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  30.93 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  32.43 
 
 		 192 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  29.06 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  25.75 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  35.11 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  28.83 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2165  Type IV secretory pathway protease TraF-like  40 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  34.04 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  34.18 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  31.91 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  34.04 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  32.43 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3710  signal peptidase I  25.41 
 
 		 272 aa  44.7  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  36.26 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  36.26 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  36.26 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  32.14 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  40.48 
 
 		 251 aa  44.7  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06711  leader peptidase I  33.33 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  35.16 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  34.04 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  34.04 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  35.16 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  34.04 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  35.16 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  34.04 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  34.04 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3856  signal peptidase I  28.15 
 
 		 265 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3769  type IV secretory protease  25.2 
 
 		 128 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  31.43 
 
 		 266 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2658  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  31.33 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1862 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5374  type IV secretory pathway protease TraF-like protein  36.67 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.705949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  32.97 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  31.18 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0628  putative conjugal transfer protein TraF  28.1 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  32.93 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0184  signal peptidase I  32.98 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  27.52 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  35.16 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  34.04 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  34.04 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  35.16 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  32.94 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  25.23 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  34.07 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  33.65 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  27.94 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  32.94 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  39.74 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2333  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  30.95 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2503  signal peptidase I  27.59 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127796  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  29.57 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  33.33 
 
 		 198 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  27.68 
 
 		 288 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  39.74 
 
 		 254 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0585  conjugal transfer protein precursor  28.57 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.961115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  30.17 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>