53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0308 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0308  type IV secretory protease  100 
 
 		 164 aa  344  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0246  type IV secretory protease  78.66 
 
 		 164 aa  283  8e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3769  type IV secretory protease  45.8 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2165  Type IV secretory pathway protease TraF-like  34.03 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0937  putative type IV secretory protease  41.46 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.320644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2322  hypothetical protein  26.95 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0661618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0684  conjugal transfer protein precursor  27.92 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2655  hypothetical protein  26.35 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.364147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  31.29 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6223  hypothetical protein  30.65 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0097  type IV conjugative transfer system signal peptidase  23.57 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.120482 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0628  putative conjugal transfer protein TraF  28.93 
 
 		 220 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0373  putative pilus assembly protein, TrhF  24.05 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2342  conjugal transfer protein precursor  24.03 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  29.61 
 
 		 206 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5374  type IV secretory pathway protease TraF-like protein  28.74 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.705949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1533  hypothetical protein  29.85 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  27.62 
 
 		 190 aa  48.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  26.97 
 
 		 190 aa  47.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6803  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  29.08 
 
 		 169 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  29.2 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  30.58 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4541  conjugal transfer pilin processing protease TraF  32.61 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.708935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  29.61 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  29.91 
 
 		 199 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  23.42 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  29.36 
 
 		 196 aa  45.1  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  33.33 
 
 		 200 aa  44.7  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  29.82 
 
 		 199 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  28.48 
 
 		 198 aa  43.9  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  29.84 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  27.13 
 
 		 271 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1333  Signal peptidase I  27.21 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0513  signal peptidase I  28.32 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.124665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  26.63 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1091  conjugation signal peptidase TraF, putative  24.31 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7435  putative conjugal transfer protein precursor  30.11 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  28.76 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  29.25 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2015  conjugal transfer protein TraF  24.78 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.494735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  29.46 
 
 		 220 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  25.15 
 
 		 209 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  28.83 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  30.14 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  52.78 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  29.2 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  33.33 
 
 		 199 aa  42  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  28.22 
 
 		 197 aa  41.6  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3080  conjugal transfer protein precursor  26.47 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  26.11 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  26.71 
 
 		 225 aa  40.8  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  29.31 
 
 		 188 aa  40.8  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  28.57 
 
 		 267 aa  40.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>