98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2165 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2165  Type IV secretory pathway protease TraF-like  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5374  type IV secretory pathway protease TraF-like protein  49.08 
 
 		 187 aa  159  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.705949 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4003  hypothetical protein  45.59 
 
 		 180 aa  138  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1533  hypothetical protein  39.71 
 
 		 194 aa  84.7  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2655  hypothetical protein  35.29 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.364147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2322  hypothetical protein  35.29 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0661618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0308  type IV secretory protease  34.03 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0246  type IV secretory protease  33.09 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  28.85 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  32.17 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  28.15 
 
 		 199 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1103  Signal peptidase I  32.81 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1333  Signal peptidase I  27.97 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1861  Signal peptidase I  30 
 
 		 208 aa  52  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0958721  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  32.14 
 
 		 187 aa  51.6  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  30.43 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  33.9 
 
 		 267 aa  51.2  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  35 
 
 		 219 aa  51.2  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  31.39 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  29.31 
 
 		 216 aa  50.8  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  26.09 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  29.59 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0778  signal peptidase I  29.31 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  35.64 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6803  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  30.5 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  32.48 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  32.08 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  30.63 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  32.17 
 
 		 226 aa  48.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  31.3 
 
 		 222 aa  47.8  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  28.93 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  26.52 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  28.45 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  33.33 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  31 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  34.41 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2531  conjugal transfer protein TraF  29.71 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400646  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  25.39 
 
 		 216 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0373  putative pilus assembly protein, TrhF  40 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9191  conjugal transfer pilin processing protease TraF  28.14 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2015  conjugal transfer protein TraF  28.57 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.494735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4229  signal peptidase I  31.85 
 
 		 176 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3183  conjugal transfer protein precursor  29.92 
 
 		 200 aa  44.7  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4541  conjugal transfer pilin processing protease TraF  28 
 
 		 177 aa  44.7  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.708935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  29.57 
 
 		 214 aa  44.7  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4714  conjugative transfer signal peptidase TraF  24.83 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  30.36 
 
 		 220 aa  44.3  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0790  Signal peptidase I  26.14 
 
 		 216 aa  44.3  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165061  hitchhiker  9.36355e-24 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  27.69 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  30.43 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  26.35 
 
 		 297 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  29.86 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  26.39 
 
 		 324 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  30.69 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2493  conjugal transfer protein traF  26.59 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.955009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  25.93 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  30.77 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  26.88 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  26.39 
 
 		 325 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  23.19 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1523  signal peptidase I  26.27 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000512014  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  31.58 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  27.27 
 
 		 214 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  25.55 
 
 		 245 aa  42.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  27.08 
 
 		 322 aa  42.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  26.73 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  33.61 
 
 		 183 aa  42  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1359  signal peptidase I  27.63 
 
 		 252 aa  42  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.562371  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  26.47 
 
 		 189 aa  42  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  31.97 
 
 		 179 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  31.58 
 
 		 321 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  32.81 
 
 		 256 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  29.79 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  29.17 
 
 		 274 aa  42  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  31.82 
 
 		 178 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  27.15 
 
 		 322 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  30.3 
 
 		 189 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  31.94 
 
 		 297 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  33.8 
 
 		 276 aa  41.6  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  31.94 
 
 		 297 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1201  signal peptidase I  30.26 
 
 		 259 aa  41.2  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2929  TraF peptidase  30.68 
 
 		 203 aa  41.2  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1242  signal peptidase I  30.26 
 
 		 259 aa  41.2  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  29.32 
 
 		 236 aa  41.2  0.008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1935  signal peptidase I  26.12 
 
 		 201 aa  40.8  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  29.17 
 
 		 230 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  29.37 
 
 		 262 aa  41.2  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  25 
 
 		 232 aa  41.2  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  29.17 
 
 		 230 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  30 
 
 		 220 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  27.04 
 
 		 238 aa  40.8  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2062  Signal peptidase I  28.12 
 
 		 201 aa  40.8  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  27.91 
 
 		 240 aa  40.8  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  29.49 
 
 		 297 aa  40.8  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  30.77 
 
 		 321 aa  40.8  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  26.95 
 
 		 187 aa  40.8  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  26.95 
 
 		 187 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  26.95 
 
 		 187 aa  40.8  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>