92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_4003 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_4003  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  371  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5374  type IV secretory pathway protease TraF-like protein  57.23 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.705949 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2165  Type IV secretory pathway protease TraF-like  45.59 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.364147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2322  hypothetical protein  32.73 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0661618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  32.26 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1533  hypothetical protein  31.71 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6803  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  33.58 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  29.21 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  33.62 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2342  conjugal transfer protein precursor  27.43 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  35.04 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  29.13 
 
 		 282 aa  51.6  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  34.21 
 
 		 200 aa  51.6  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  27.74 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  40.54 
 
 		 245 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2493  conjugal transfer protein traF  31.18 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.955009 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  28.66 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  28.06 
 
 		 247 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  28.86 
 
 		 286 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  28.78 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0778  signal peptidase I  32.14 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  30.3 
 
 		 267 aa  48.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  28.83 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1103  Signal peptidase I  26.61 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  26.62 
 
 		 247 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  39.74 
 
 		 263 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  32.5 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  27.59 
 
 		 249 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  31.9 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0308  type IV secretory protease  27.91 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  27.59 
 
 		 260 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0246  type IV secretory protease  29.82 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  34.21 
 
 		 262 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  44.83 
 
 		 290 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  33.77 
 
 		 279 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  31.93 
 
 		 220 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  37.66 
 
 		 262 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  33.77 
 
 		 278 aa  45.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1613  Peptidase S26, conserved region  29.56 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  41.07 
 
 		 274 aa  45.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  29.91 
 
 		 225 aa  45.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  30.56 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  31.19 
 
 		 373 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  32.74 
 
 		 198 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  25.14 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  28.57 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  24.49 
 
 		 271 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  29.91 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  27.5 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000528092  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0206  signal peptidase I  26.62 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678677  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  32.58 
 
 		 263 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  29.63 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  27.15 
 
 		 266 aa  43.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  26.21 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  34.57 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  26.21 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  26.21 
 
 		 252 aa  42.7  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  24.87 
 
 		 214 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  31.9 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  34 
 
 		 300 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  42.59 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  40.26 
 
 		 259 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  30.56 
 
 		 190 aa  42  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  28.29 
 
 		 200 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  28.29 
 
 		 200 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  23.97 
 
 		 245 aa  42  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  32.11 
 
 		 198 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  26.8 
 
 		 299 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  28.7 
 
 		 193 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  25.85 
 
 		 268 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  28.47 
 
 		 248 aa  42  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  25.85 
 
 		 268 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  41.07 
 
 		 287 aa  42  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  25.85 
 
 		 268 aa  42  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4229  signal peptidase I  35.96 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  31.45 
 
 		 221 aa  41.6  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  31.65 
 
 		 230 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1076  peptidase S26A, signal peptidase I  32.29 
 
 		 259 aa  41.6  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  31.25 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  36.92 
 
 		 255 aa  41.2  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4714  conjugative transfer signal peptidase TraF  30.34 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  29.46 
 
 		 190 aa  41.2  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  41.38 
 
 		 293 aa  41.6  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  41.07 
 
 		 250 aa  41.2  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  40.74 
 
 		 381 aa  41.2  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  29.75 
 
 		 284 aa  40.8  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  31.36 
 
 		 226 aa  41.2  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  33.85 
 
 		 256 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  30.65 
 
 		 255 aa  41.2  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  33.33 
 
 		 262 aa  40.8  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  39.29 
 
 		 257 aa  40.8  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>