More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1076 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1076  peptidase S26A, signal peptidase I  100 
 
 
259 aa  533  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1359  signal peptidase I  45.53 
 
 
252 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.562371  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1719  signal peptidase I  40.25 
 
 
260 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1657  signal peptidase I  34.58 
 
 
293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.330957  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1649  peptidase S26A, signal peptidase I  40.21 
 
 
217 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.301306 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1333  Signal peptidase I  33.83 
 
 
205 aa  105  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  32.71 
 
 
207 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  32.86 
 
 
189 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1861  Signal peptidase I  33.69 
 
 
208 aa  98.6  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0958721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  33.5 
 
 
184 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  29.77 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  32.16 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  28.84 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1183  signal peptidase I  30.65 
 
 
193 aa  90.1  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  31.51 
 
 
214 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1330  thylakoidal processing peptidase  31 
 
 
174 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  32.42 
 
 
192 aa  85.9  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  30.77 
 
 
262 aa  85.9  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  30.58 
 
 
173 aa  85.5  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  32.68 
 
 
183 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  34.13 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  31.34 
 
 
200 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  31.34 
 
 
200 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  31.79 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  32.35 
 
 
183 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  29.65 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  29.65 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  27.68 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  29.65 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1935  signal peptidase I  32.39 
 
 
201 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  29.13 
 
 
187 aa  84  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  30.29 
 
 
217 aa  84  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  29.57 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  31 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  30.33 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  30 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  29.65 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  29.65 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  29.65 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  29.15 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  31.53 
 
 
171 aa  82  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  31.22 
 
 
173 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  29.15 
 
 
187 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  30.88 
 
 
183 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  30.88 
 
 
183 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  29.15 
 
 
187 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  29.15 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  31.37 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  27.63 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  27.63 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2510  signal peptidase I  30.2 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266939  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  30.46 
 
 
185 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2062  Signal peptidase I  30.37 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  30.88 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  29.22 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  30.88 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  30.88 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  30.88 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  30.88 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  34.83 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  30.88 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  30.88 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  30.43 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  30.57 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  27.59 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  30.73 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  33.78 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0790  Signal peptidase I  28.11 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165061  hitchhiker  9.36355e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  29.53 
 
 
183 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  28.4 
 
 
247 aa  79  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  32.3 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  32.58 
 
 
189 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  30.51 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  30.4 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  29.02 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  29.02 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  29.02 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  33.33 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  29.02 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  29.02 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  32.43 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  29.81 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  29.02 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  29.96 
 
 
215 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  29.7 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  27.94 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  29.06 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2503  signal peptidase I  28.25 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  27.14 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10441  leader peptidase I  26.46 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3112  Signal peptidase I  29.44 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2871  Signal peptidase I  29.44 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0582592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2841  signal peptidase I  29.44 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000384139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3086  Signal peptidase I  29.44 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3092  signal peptidase I  29.44 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  29.1 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  30.96 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  30.74 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  30 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2863  signal peptidase I  28.72 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>