More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1935 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1935  signal peptidase I  100 
 
 
201 aa  412  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1333  Signal peptidase I  50.24 
 
 
205 aa  198  5e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2062  Signal peptidase I  51.55 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1861  Signal peptidase I  49.05 
 
 
208 aa  195  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0958721  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  48.08 
 
 
207 aa  194  9e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0790  Signal peptidase I  43.43 
 
 
216 aa  137  7e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165061  hitchhiker  9.36355e-24 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1860  Signal peptidase I  43.95 
 
 
194 aa  119  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  35.57 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  35.57 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  39.2 
 
 
186 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1103  Signal peptidase I  32.37 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000489704  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  39.89 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  35 
 
 
183 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  34.05 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  35.03 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  37.64 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  35.59 
 
 
183 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  37.29 
 
 
183 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  37.64 
 
 
183 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  37.64 
 
 
183 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  37.64 
 
 
183 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  37.64 
 
 
183 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  37.64 
 
 
183 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  37.64 
 
 
183 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  34.05 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  34.05 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  38.18 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  34.05 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  37.64 
 
 
183 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  34.59 
 
 
187 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  35.14 
 
 
187 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  35.26 
 
 
183 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  35.26 
 
 
183 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  35.96 
 
 
171 aa  105  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  33.51 
 
 
187 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  35.03 
 
 
183 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  35.03 
 
 
183 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  35.03 
 
 
183 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  35.03 
 
 
183 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  35.03 
 
 
183 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  35.03 
 
 
183 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  34.05 
 
 
187 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  34.05 
 
 
187 aa  104  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  37.08 
 
 
183 aa  104  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  34.05 
 
 
187 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  32.97 
 
 
187 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  34.46 
 
 
183 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  36.47 
 
 
220 aa  101  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0553  signal peptidase IB  35.91 
 
 
191 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  32.64 
 
 
185 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  37.91 
 
 
189 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  32.45 
 
 
220 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  33.72 
 
 
200 aa  97.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  33.72 
 
 
200 aa  97.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0024  signal peptidase I  34.78 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  35.59 
 
 
182 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  33.53 
 
 
214 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  29.84 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  27.75 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  31.09 
 
 
219 aa  92  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  33.69 
 
 
189 aa  92  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1076  peptidase S26A, signal peptidase I  33.16 
 
 
259 aa  91.7  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  29.19 
 
 
173 aa  91.3  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  30.05 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0778  signal peptidase I  39.2 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  32.34 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  33.17 
 
 
271 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1741  signal peptidase I  31.05 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  29.9 
 
 
199 aa  89  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  28.14 
 
 
200 aa  88.2  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  32.79 
 
 
176 aa  87.8  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0528  signal peptidase I S  35.54 
 
 
178 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0529  signal peptidase I S  36.14 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  29.76 
 
 
288 aa  87.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  28.95 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  30 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  32.12 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0073  signal peptidase I  27.78 
 
 
183 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0392  signal peptidase I (SPase I)  35.54 
 
 
178 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  32.8 
 
 
267 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2588  signal peptidase  30.93 
 
 
208 aa  85.9  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  32.95 
 
 
173 aa  85.9  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0459  signal peptidase I S  35.54 
 
 
177 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0388  signal peptidase I  35.54 
 
 
178 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.932746  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  30.43 
 
 
266 aa  85.1  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  30.81 
 
 
190 aa  84.7  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  29.32 
 
 
221 aa  84.7  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4845  signal peptidase I  34.34 
 
 
177 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  30.1 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0400  signal peptidase I  32.02 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  30.6 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  32.43 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  30.43 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  31.09 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1723  signal peptidase I  33.73 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  28.65 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2863  signal peptidase I  32 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752268  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  28.49 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  28.11 
 
 
248 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  34.62 
 
 
187 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>