More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2588 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2588  signal peptidase  100 
 
 
208 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1741  signal peptidase I  51.94 
 
 
207 aa  218  6e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1723  signal peptidase I  55.88 
 
 
197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  39.59 
 
 
184 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  37.86 
 
 
183 aa  118  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0790  Signal peptidase I  35.24 
 
 
216 aa  115  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165061  hitchhiker  9.36355e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1103  Signal peptidase I  33.81 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000489704  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  35.15 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  34.98 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  34.16 
 
 
183 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  34.16 
 
 
183 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  34.16 
 
 
183 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  34.16 
 
 
183 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  34.16 
 
 
183 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  34.16 
 
 
183 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  34.16 
 
 
183 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  33.5 
 
 
183 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  33.5 
 
 
183 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  34 
 
 
187 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  34 
 
 
187 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  34 
 
 
187 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  33.66 
 
 
188 aa  104  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  33.5 
 
 
187 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  34.42 
 
 
187 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  33 
 
 
187 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  33 
 
 
187 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  33 
 
 
187 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  33.5 
 
 
187 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  32.04 
 
 
182 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  33.5 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  32.84 
 
 
189 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  31.66 
 
 
183 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  31.66 
 
 
183 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  31.66 
 
 
183 aa  96.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  31.66 
 
 
183 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  30.46 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  31.66 
 
 
183 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  31.66 
 
 
183 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  33.17 
 
 
183 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  33.17 
 
 
183 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  30.77 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  35.18 
 
 
186 aa  92  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  33.33 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  31.58 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  32.8 
 
 
186 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  31.58 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  31.58 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0553  signal peptidase IB  31.15 
 
 
191 aa  88.2  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1333  Signal peptidase I  32.32 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  31.48 
 
 
297 aa  84.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  29.86 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  31.02 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0024  signal peptidase I  29.32 
 
 
192 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  32.41 
 
 
325 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1935  signal peptidase I  31.67 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  29.85 
 
 
173 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  31.08 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  30.97 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2062  Signal peptidase I  30.39 
 
 
201 aa  82  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  30.97 
 
 
325 aa  81.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  31.8 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0393  signal peptidase I  29.05 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  31.75 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  32.11 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0388  signal peptidase I  28.5 
 
 
178 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.932746  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1861  Signal peptidase I  31.72 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0958721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  32.54 
 
 
185 aa  79  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  31.34 
 
 
297 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  31.34 
 
 
297 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  31.34 
 
 
297 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  28.78 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0529  signal peptidase I S  28.23 
 
 
177 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0400  signal peptidase I  28.86 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  31.34 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  31.34 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0459  signal peptidase I S  27.75 
 
 
177 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  31.5 
 
 
173 aa  77  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0392  signal peptidase I (SPase I)  27.27 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  30.66 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  27.86 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0023  signal peptidase I  26.6 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0767721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0478  signal peptidase I  28.17 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  29.85 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  32.24 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  31.22 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1719  signal peptidase I  28.4 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  31.51 
 
 
299 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  30.77 
 
 
322 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  27.57 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  29.15 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0528  signal peptidase I S  27.75 
 
 
178 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4845  signal peptidase I  27.7 
 
 
177 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2156  signal peptidase I  30.39 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  29.08 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  29.65 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3079  signal peptidase I  27.09 
 
 
173 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  30.8 
 
 
322 aa  71.6  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  27.67 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  31.46 
 
 
321 aa  71.2  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  28.17 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>