37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4229 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4229  signal peptidase I  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1533  hypothetical protein  35.61 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  36.07 
 
 		 189 aa  51.2  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2655  hypothetical protein  39.78 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.364147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6803  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  36.72 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  41.18 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2322  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0661618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  37.62 
 
 		 192 aa  47.8  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  36.07 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5374  type IV secretory pathway protease TraF-like protein  33.09 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.705949 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  37.62 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  37.33 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  33.62 
 
 		 267 aa  45.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  36.26 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  34.02 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2165  Type IV secretory pathway protease TraF-like  31.85 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  30.85 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  31.91 
 
 		 286 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  30.91 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  33.77 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000528092  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  35.53 
 
 		 259 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  28.21 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  34.15 
 
 		 255 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  37.04 
 
 		 249 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  28.05 
 
 		 172 aa  42  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  27.85 
 
 		 275 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  30.51 
 
 		 263 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4003  hypothetical protein  35.96 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  33.33 
 
 		 216 aa  41.6  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  25.77 
 
 		 247 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  33.33 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  32.76 
 
 		 220 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  31.33 
 
 		 221 aa  41.2  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179643  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  34.94 
 
 		 171 aa  41.2  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  31.78 
 
 		 190 aa  41.2  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  28.95 
 
 		 220 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  31.07 
 
 		 221 aa  40.8  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>