63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4176 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6803  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  61.48 
 
 		 169 aa  169  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1533  hypothetical protein  35.37 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2655  hypothetical protein  33.54 
 
 		 196 aa  73.9  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.364147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2322  hypothetical protein  34.18 
 
 		 198 aa  73.6  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0661618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4209  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  30.97 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5374  type IV secretory pathway protease TraF-like protein  30.06 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.705949 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4003  hypothetical protein  32.56 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0182  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  31.25 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2165  Type IV secretory pathway protease TraF-like  28.47 
 
 		 174 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2802  conjugal transfer protein precursor  32.61 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0978  putative conjugal transfer protein TraF  32.1 
 
 		 209 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1030  putative conjugal transfer protein TraF  33.33 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.201544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0373  putative pilus assembly protein, TrhF  31.01 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0362  conjugal transfer protein precursor  31.43 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0628  putative conjugal transfer protein TraF  30 
 
 		 220 aa  50.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  38.64 
 
 		 201 aa  50.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7735  putative conjugal transfer protein precursor  32.72 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  26.75 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  31.19 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  30.7 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2871  putative conjugal transfer protein precursor  31.21 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4229  signal peptidase I  36.07 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  30.43 
 
 		 214 aa  47.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000528092  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  25.2 
 
 		 206 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3349  putative conjugal transfer protein (traF)  28.26 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.920518 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2356  conjugal transfer protein TraF  32.39 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  27.98 
 
 		 198 aa  47.4  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3080  conjugal transfer protein precursor  28.22 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0849  conjugal transfer protein precursor  31.29 
 
 		 186 aa  47.4  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  31.58 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2531  conjugal transfer protein TraF  29.03 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400646  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3556  conjugal transfer protein precursor  28.26 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1095  signal peptidase I  26.25 
 
 		 248 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2493  conjugal transfer protein traF  28.92 
 
 		 196 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.955009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0454  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  35.11 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0706  conjugal transfer protein precursor  28.82 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3025  signal peptidase I  32.5 
 
 		 248 aa  44.7  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226835  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0136  hypothetical protein  29.86 
 
 		 310 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0684  conjugal transfer protein precursor  29.17 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0308  type IV secretory protease  28.76 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7435  putative conjugal transfer protein precursor  26.09 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2015  conjugal transfer protein TraF  27.5 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.494735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6223  hypothetical protein  31.67 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0246  type IV secretory protease  35.63 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2929  TraF peptidase  34.41 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0878  hypothetical protein  19.63 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3906  conjugal transfer protein precursor  27.11 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1200  conjugal transfer protein precursor  30.3 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3183  conjugal transfer protein precursor  31.65 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3535  conjugal transfer protein precursor  30.3 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0756  putative conjugal transfer protein precursor  29.41 
 
 		 181 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  25.17 
 
 		 263 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  26.95 
 
 		 260 aa  42  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3011  conjugal transfer protein precursor  29.08 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1172  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  20.86 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2658  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  29.41 
 
 		 199 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1862 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  28.95 
 
 		 192 aa  41.2  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  27.97 
 
 		 266 aa  41.2  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  26.95 
 
 		 226 aa  41.2  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2250  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  30.15 
 
 		 172 aa  41.2  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  23.96 
 
 		 230 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  28.66 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>