154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6803 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6803  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  100 
 
 		 169 aa  341  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  56.96 
 
 		 158 aa  174  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2322  hypothetical protein  39.85 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0661618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1533  hypothetical protein  39.57 
 
 		 194 aa  80.9  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2655  hypothetical protein  36.69 
 
 		 196 aa  77.4  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.364147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5374  type IV secretory pathway protease TraF-like protein  34.97 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.705949 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4003  hypothetical protein  33.58 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3769  type IV secretory protease  30.23 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  28.78 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  33.05 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  37.38 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  32.37 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  29.2 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  28.81 
 
 		 198 aa  52  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0373  putative pilus assembly protein, TrhF  30.34 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  31.48 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4209  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  27.45 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  31.3 
 
 		 263 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  30.91 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  31.25 
 
 		 284 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  26.34 
 
 		 373 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4229  signal peptidase I  36.72 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2165  Type IV secretory pathway protease TraF-like  30.5 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  31.25 
 
 		 284 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0308  type IV secretory protease  29.03 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  32.85 
 
 		 262 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  31.13 
 
 		 325 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  30.34 
 
 		 284 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  29.86 
 
 		 284 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  29.86 
 
 		 284 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  29.87 
 
 		 299 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  29.86 
 
 		 284 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  29.86 
 
 		 284 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0778  signal peptidase I  36.89 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  35.96 
 
 		 200 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  35.96 
 
 		 200 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  29.71 
 
 		 240 aa  47.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  31.17 
 
 		 299 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  28.9 
 
 		 297 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  27.21 
 
 		 255 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2622  conjugal transfer protein traF  30.82 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  28.87 
 
 		 249 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  28.89 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  29.37 
 
 		 284 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0097  type IV conjugative transfer system signal peptidase  28.65 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.120482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  28.32 
 
 		 297 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  28.66 
 
 		 247 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  28.67 
 
 		 283 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  28.21 
 
 		 252 aa  45.8  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  35.4 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1605  conjugal transfer protein precursor  34.96 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3349  putative conjugal transfer protein (traF)  29.63 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.920518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  29.1 
 
 		 267 aa  45.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  27.46 
 
 		 247 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  28.57 
 
 		 255 aa  45.1  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  29.77 
 
 		 286 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4541  conjugal transfer pilin processing protease TraF  29.14 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.708935  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6223  hypothetical protein  29.66 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  27.75 
 
 		 297 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  33.33 
 
 		 271 aa  44.7  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  32.37 
 
 		 267 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  28.3 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  35.9 
 
 		 225 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  31.25 
 
 		 201 aa  44.7  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3821  putative conjugal transfer protein precursor  34.69 
 
 		 181 aa  44.3  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  28.93 
 
 		 200 aa  44.3  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  28.06 
 
 		 270 aa  44.3  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  29.65 
 
 		 297 aa  44.3  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  27.86 
 
 		 247 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  29.65 
 
 		 297 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  29.65 
 
 		 297 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2802  conjugal transfer protein precursor  29.24 
 
 		 181 aa  44.3  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  29.65 
 
 		 297 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  27.63 
 
 		 297 aa  44.3  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  32.08 
 
 		 269 aa  44.3  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  29.65 
 
 		 297 aa  44.3  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  29.65 
 
 		 297 aa  44.3  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  27.63 
 
 		 297 aa  44.3  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  34.51 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  28.07 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  28.32 
 
 		 297 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  28.32 
 
 		 297 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  29.71 
 
 		 248 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  29.71 
 
 		 248 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  28.32 
 
 		 297 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  28.32 
 
 		 297 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  28.32 
 
 		 297 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  28.32 
 
 		 297 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  28.32 
 
 		 297 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  31.75 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  30.07 
 
 		 256 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3025  signal peptidase I  31.25 
 
 		 248 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226835  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  29.73 
 
 		 297 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  28.57 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  27.46 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  31.86 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  31.65 
 
 		 256 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  38.1 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  32.48 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  27.46 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>