77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0097 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0097  type IV conjugative transfer system signal peptidase  100 
 
 		 176 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.120482 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4209  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  26.79 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0373  putative pilus assembly protein, TrhF  30.77 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6223  hypothetical protein  29.63 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1091  conjugation signal peptidase TraF, putative  31.21 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  25.15 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0308  type IV secretory protease  23.57 
 
 		 164 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  25.43 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  36.9 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2322  hypothetical protein  33.9 
 
 		 198 aa  51.2  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0661618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1523  signal peptidase I  28.57 
 
 		 178 aa  51.2  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000512014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2655  hypothetical protein  33.87 
 
 		 196 aa  51.2  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.364147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  33.04 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1533  hypothetical protein  28.95 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0246  type IV secretory protease  22.93 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  28.33 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  34.52 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2531  conjugal transfer protein TraF  33.02 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400646  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  34.78 
 
 		 268 aa  48.1  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  32.82 
 
 		 216 aa  48.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  31.58 
 
 		 222 aa  47.8  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  29.03 
 
 		 169 aa  47.8  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  37.78 
 
 		 221 aa  47.4  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  31.48 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  30 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  32.2 
 
 		 271 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10441  leader peptidase I  28.04 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2015  conjugal transfer protein TraF  26.5 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.494735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  30.15 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  31.86 
 
 		 199 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  30.63 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6803  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  30 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  31.46 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  30 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  30 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  30.77 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  37.36 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1465  signal peptidase I  28.47 
 
 		 431 aa  43.5  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  25.54 
 
 		 262 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1510  conjugal transfer protein precursor  32.58 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  30.36 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  27.91 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  29.41 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  24.69 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  29.41 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  31.25 
 
 		 183 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  26.17 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  32.29 
 
 		 183 aa  42  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  31.87 
 
 		 216 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  26.01 
 
 		 199 aa  42  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18791  leader peptidase I  25.66 
 
 		 206 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  28.33 
 
 		 183 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  28.33 
 
 		 183 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  28.33 
 
 		 183 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  28.33 
 
 		 183 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  28.33 
 
 		 183 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  28.33 
 
 		 183 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  28.33 
 
 		 183 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  31.25 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  31.25 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  31.87 
 
 		 225 aa  41.6  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  31.25 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  31.25 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  25.69 
 
 		 196 aa  41.6  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  24.02 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  31.25 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  31.25 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  32.29 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0849  conjugal transfer protein precursor  29.47 
 
 		 186 aa  41.2  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5335  conjugal transfer protein TraF  29.91 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  26.72 
 
 		 190 aa  41.2  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  26.17 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  29.82 
 
 		 226 aa  41.2  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2622  conjugal transfer protein traF  24.47 
 
 		 199 aa  40.8  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  30.21 
 
 		 183 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  30.21 
 
 		 183 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  24.02 
 
 		 213 aa  40.8  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>