More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1465 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1465  signal peptidase I  100 
 
 		 431 aa  892    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3196  signal peptidase I  28.74 
 
 		 436 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  33.33 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  31.28 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  27.78 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  27.22 
 
 		 214 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  30.56 
 
 		 187 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  28.33 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  33.94 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  27.47 
 
 		 200 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  27.47 
 
 		 200 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  30.27 
 
 		 209 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  29.9 
 
 		 220 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  30.32 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  27.09 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  31.16 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  30.88 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  30.33 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  27.53 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  29.91 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  27.6 
 
 		 192 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  31.22 
 
 		 232 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  27.6 
 
 		 193 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1716  putative signal peptidase I (SPase I) protein  31.34 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  28.14 
 
 		 190 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  32.39 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  28.96 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  29.74 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  31.58 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  31.28 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  31.58 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  33.85 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  29.78 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  29.47 
 
 		 305 aa  67  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  27.6 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  28.37 
 
 		 174 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  29.38 
 
 		 184 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  29.35 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1540  signal peptidase I  29.21 
 
 		 220 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  30.15 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  33.54 
 
 		 187 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  30.15 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  30.15 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  30.15 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  29.35 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  31.15 
 
 		 182 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  30.15 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1681  signal peptidase I  30.73 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0422344  normal  0.0473172 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  30.15 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  30.15 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  30.05 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  29.19 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2924  signal peptidase I family protein  30.05 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1864  signal peptidase I  29.44 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  29.44 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  31.28 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  31.28 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  31.87 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  31.87 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  29.67 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  31.28 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  31.28 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  26.24 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1481  signal peptidase I  28.65 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  29.65 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  30.69 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  29.65 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  29.65 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  29.17 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1861  Signal peptidase I  28.27 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0958721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  30.99 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  29.49 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2685  signal peptidase I  29.05 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  30.29 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  33.5 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1546  signal peptidase I  28.65 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  29.05 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  27.65 
 
 		 199 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2782  signal peptidase I  29.61 
 
 		 220 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.310144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  28.88 
 
 		 220 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  28.95 
 
 		 222 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  28.36 
 
 		 322 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  28.3 
 
 		 268 aa  62.4  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  26.21 
 
 		 243 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  29.13 
 
 		 288 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  28.33 
 
 		 173 aa  61.6  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  27.54 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  32.93 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  28.57 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  28.49 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  28.19 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  28.87 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  31.12 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  29.23 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1665  signal peptidase I  30.68 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548512  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  28.14 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  27.07 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  29.23 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  26.59 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  25.84 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>