More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3196 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3196  signal peptidase I  100 
 
 		 436 aa  890    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1465  signal peptidase I  29.2 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  34.44 
 
 		 217 aa  86.7  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  35.57 
 
 		 220 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  33.33 
 
 		 190 aa  82.8  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  31.82 
 
 		 216 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  29.41 
 
 		 198 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  35.57 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  30.92 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  31.76 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  30.13 
 
 		 203 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  31.33 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  30.07 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  30.07 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  30 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  30 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  32.67 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  30.05 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  30.05 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  30.05 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  30.05 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  30.05 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  30.05 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  30.05 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  28.57 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  30.77 
 
 		 266 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  36.77 
 
 		 236 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  28.96 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  30.05 
 
 		 297 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  27.59 
 
 		 232 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3856  signal peptidase I  32.37 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  34.64 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  29.35 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  28.42 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  31.58 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  32.7 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  27.74 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  28.57 
 
 		 322 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  28.57 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  32.37 
 
 		 187 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  32.54 
 
 		 198 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  28.8 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  28.8 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  28.8 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  27.39 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  30.17 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  28.42 
 
 		 297 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  29.01 
 
 		 200 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  27.87 
 
 		 297 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  28.42 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  34.73 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  28.42 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  32.37 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  28.76 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  31.33 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  32.69 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  31.05 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  30.26 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  29.74 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  29.56 
 
 		 276 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  30.26 
 
 		 174 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  27.67 
 
 		 185 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  28.57 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  31.36 
 
 		 240 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  28.25 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  29.49 
 
 		 188 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  30.73 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  29.49 
 
 		 188 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  27.01 
 
 		 268 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  29.35 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  30.73 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  33.11 
 
 		 192 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  33.08 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  27.93 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  32.89 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  32.21 
 
 		 173 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  33.11 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  25.77 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  27.47 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  35 
 
 		 194 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  29.14 
 
 		 173 aa  67  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  32.37 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  28.34 
 
 		 262 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2863  signal peptidase I  27.52 
 
 		 173 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  26.32 
 
 		 186 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  30.2 
 
 		 189 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  30.93 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  28.26 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  28.42 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  28.11 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  29.07 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  32.77 
 
 		 199 aa  65.1  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3112  Signal peptidase I  26.85 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2871  Signal peptidase I  26.85 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0582592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2841  signal peptidase I  26.85 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000384139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3086  Signal peptidase I  26.85 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3092  signal peptidase I  26.85 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2801  signal peptidase I  26.85 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3111  signal peptidase I  26.85 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.349413  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1531  signal peptidase I  29.27 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.347423  normal  0.266743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>