61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2655 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2655  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.364147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2322  hypothetical protein  89.39 
 
 		 198 aa  349  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0661618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1533  hypothetical protein  63.59 
 
 		 194 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6803  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  36.69 
 
 		 169 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  33.54 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2165  Type IV secretory pathway protease TraF-like  35.29 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4003  hypothetical protein  35.38 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5374  type IV secretory pathway protease TraF-like protein  34.78 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.705949 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0373  putative pilus assembly protein, TrhF  34.88 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0246  type IV secretory protease  32.06 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0308  type IV secretory protease  26.35 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  35.09 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3769  type IV secretory protease  26.72 
 
 		 128 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9191  conjugal transfer pilin processing protease TraF  30.82 
 
 		 176 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0778  signal peptidase I  30 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0097  type IV conjugative transfer system signal peptidase  33.87 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.120482 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  26.62 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  29.82 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4229  signal peptidase I  39.78 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6223  hypothetical protein  30.77 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  32.74 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  35.45 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  33.33 
 
 		 219 aa  48.5  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  28.81 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  29.13 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  30.7 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  33.94 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  33.94 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  34.55 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  28.68 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  26.8 
 
 		 190 aa  44.7  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  31.19 
 
 		 171 aa  44.7  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  27.59 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8132  conjugal transfer pilin processing protease TraF  30.34 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.562058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  30.09 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  30.19 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  38.36 
 
 		 297 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  31.58 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  38.36 
 
 		 297 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  30.7 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7065  conjugal transfer pilin processing protease TraF  26.21 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0024  signal peptidase I  28.36 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  33.77 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  25 
 
 		 172 aa  42.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  38.36 
 
 		 297 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  38.36 
 
 		 297 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  38.36 
 
 		 297 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  38.36 
 
 		 297 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  30.93 
 
 		 198 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0937  putative type IV secretory protease  34.52 
 
 		 167 aa  42  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.320644  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  38.36 
 
 		 297 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  26.86 
 
 		 190 aa  42  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  38.36 
 
 		 297 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1605  conjugal transfer protein precursor  34.31 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  26.05 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  30.56 
 
 		 256 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  36.99 
 
 		 297 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  30.71 
 
 		 262 aa  41.6  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0206  signal peptidase I  30.08 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678677  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  36.99 
 
 		 297 aa  41.2  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0684  conjugal transfer protein precursor  27.08 
 
 		 193 aa  41.2  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>