36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3769 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3769  type IV secretory protease  100 
 
 		 128 aa  267  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0308  type IV secretory protease  45.8 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0246  type IV secretory protease  42.75 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0937  putative type IV secretory protease  39.47 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.320644  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6803  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  30 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2655  hypothetical protein  26.72 
 
 		 196 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.364147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2322  hypothetical protein  28.57 
 
 		 198 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0661618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6223  hypothetical protein  25.83 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1935  signal peptidase I  32.79 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1533  hypothetical protein  27.82 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0373  putative pilus assembly protein, TrhF  25.2 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0878  hypothetical protein  23.36 
 
 		 154 aa  42.7  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1605  conjugal transfer protein precursor  33.73 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  24.24 
 
 		 168 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  33.68 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  36 
 
 		 324 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  36 
 
 		 324 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  36 
 
 		 324 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2342  conjugal transfer protein precursor  27.94 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  36 
 
 		 324 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  36 
 
 		 324 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  36 
 
 		 324 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  36 
 
 		 324 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  36 
 
 		 324 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3196  signal peptidase I  30.16 
 
 		 436 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  43.48 
 
 		 324 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  43.48 
 
 		 324 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  43.48 
 
 		 324 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  43.48 
 
 		 324 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  43.48 
 
 		 324 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0652  signal peptidase I  46.15 
 
 		 295 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0362  signal peptidase I  26.42 
 
 		 238 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0817224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  50 
 
 		 200 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  50 
 
 		 200 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  37.25 
 
 		 324 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1510  conjugal transfer protein precursor  31.33 
 
 		 180 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>