108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1533 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1533  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2322  hypothetical protein  70.59 
 
 		 198 aa  247  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0661618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2655  hypothetical protein  63.59 
 
 		 196 aa  244  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.364147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2165  Type IV secretory pathway protease TraF-like  39.71 
 
 		 174 aa  84.7  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6803  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  39.57 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  35.37 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4003  hypothetical protein  34.35 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0373  putative pilus assembly protein, TrhF  30.56 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5374  type IV secretory pathway protease TraF-like protein  33.09 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.705949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  33.33 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  30.17 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  33.63 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  28.91 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4229  signal peptidase I  35.61 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  35.04 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  34.02 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  30.1 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  30.63 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  30.7 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  34.23 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  28.24 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  28.89 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  31.43 
 
 		 171 aa  52  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  31.25 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  29.46 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  29.86 
 
 		 220 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0628  putative conjugal transfer protein TraF  33.33 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  34.02 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9191  conjugal transfer pilin processing protease TraF  31.03 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0246  type IV secretory protease  30.88 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0308  type IV secretory protease  29.85 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  29.82 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  26.88 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  28.57 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  26.12 
 
 		 276 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0097  type IV conjugative transfer system signal peptidase  28.95 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.120482 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  28.8 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  29.7 
 
 		 256 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  28.74 
 
 		 255 aa  48.9  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0978  putative conjugal transfer protein TraF  30.23 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  29.23 
 
 		 267 aa  48.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  33.96 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  28.57 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  31.69 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  25.9 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000528092  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5335  conjugal transfer protein TraF  32.14 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  26.29 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2356  conjugal transfer protein TraF  30.43 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0778  signal peptidase I  27.17 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  28.95 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  33.07 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  33.07 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  28.14 
 
 		 256 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1649  peptidase S26A, signal peptidase I  33.67 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.301306 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  34.21 
 
 		 271 aa  45.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  27.14 
 
 		 276 aa  45.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2622  conjugal transfer protein traF  30.67 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0937  putative type IV secretory protease  27.56 
 
 		 167 aa  45.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.320644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  30 
 
 		 255 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  32.98 
 
 		 373 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  30.4 
 
 		 289 aa  45.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  37.04 
 
 		 186 aa  45.4  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2309  signal peptidase I  27.27 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  25.87 
 
 		 247 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0576  signal peptidase I  25 
 
 		 232 aa  44.7  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0345367 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  26.42 
 
 		 240 aa  44.7  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3769  type IV secretory protease  27.82 
 
 		 128 aa  44.7  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  29.41 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1861  Signal peptidase I  25.18 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0958721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  25.87 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  28.57 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  27.05 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  26.72 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1030  putative conjugal transfer protein TraF  32.39 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.201544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2043  signal peptidase I  38.98 
 
 		 372 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  28.95 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  27.08 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  27.81 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  30.17 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  31.65 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  32.94 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  30.28 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  27.78 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  25.62 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  33.64 
 
 		 262 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  28.18 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4719  signal peptidase I  31.52 
 
 		 389 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0134  signal peptidase I  26.32 
 
 		 219 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2706  signal peptidase I  27.27 
 
 		 220 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  35.59 
 
 		 275 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  36.51 
 
 		 264 aa  42  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0210  signal peptidase I  33.33 
 
 		 378 aa  41.6  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00024847  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  27.07 
 
 		 270 aa  41.6  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  27.08 
 
 		 248 aa  41.6  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  27.08 
 
 		 248 aa  41.6  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  27.94 
 
 		 275 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  27.21 
 
 		 216 aa  41.6  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1333  Signal peptidase I  24.31 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  26.42 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>