66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2322 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2322  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0661618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2655  hypothetical protein  89.39 
 
 		 196 aa  349  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.364147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1533  hypothetical protein  70.59 
 
 		 194 aa  247  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6803  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  39.85 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  34.18 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2165  Type IV secretory pathway protease TraF-like  35.29 
 
 		 174 aa  72  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5374  type IV secretory pathway protease TraF-like protein  36.11 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.705949 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4003  hypothetical protein  35.29 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0246  type IV secretory protease  32.06 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0308  type IV secretory protease  26.95 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  31.71 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  36.84 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0373  putative pilus assembly protein, TrhF  31.79 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  35.4 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  35.4 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0097  type IV conjugative transfer system signal peptidase  33.9 
 
 		 176 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.120482 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6223  hypothetical protein  31.47 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  35.06 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3769  type IV secretory protease  28.57 
 
 		 128 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  36.36 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  31.82 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  30.63 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  31.58 
 
 		 226 aa  48.5  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4229  signal peptidase I  33.33 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  36.04 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  36.04 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  30 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  30.77 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0206  signal peptidase I  30.83 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  32.65 
 
 		 256 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8132  conjugal transfer pilin processing protease TraF  34.52 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.562058  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  33.64 
 
 		 171 aa  46.6  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  35.77 
 
 		 285 aa  45.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  30.12 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  29.2 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  30.93 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  32.99 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  32.08 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  30.51 
 
 		 219 aa  44.7  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  30.77 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  35.85 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  35.11 
 
 		 373 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  28.95 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  30.7 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0878  hypothetical protein  24.78 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  32 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  35.25 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0937  putative type IV secretory protease  33 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.320644  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  29.32 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  30.56 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  30.36 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  28.95 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0778  signal peptidase I  28.82 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  38.36 
 
 		 297 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  38.36 
 
 		 297 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9191  conjugal transfer pilin processing protease TraF  28.57 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1076  peptidase S26A, signal peptidase I  33.09 
 
 		 259 aa  42  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  41.67 
 
 		 262 aa  42  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4541  conjugal transfer pilin processing protease TraF  33.33 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.708935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  29.82 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  32.47 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  44.29 
 
 		 256 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  28.14 
 
 		 209 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0024  signal peptidase I  32 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  32.38 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  32.28 
 
 		 262 aa  41.2  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>