30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0878 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0878  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  290  4e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1172  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  67.55 
 
 		 155 aa  209  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0136  hypothetical protein  26.14 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2871  putative conjugal transfer protein precursor  23.53 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3373  conjugal transfer protein precursor  24.84 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4714  conjugative transfer signal peptidase TraF  24.22 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2247  conjugal transfer peptidase TraF  25.16 
 
 		 178 aa  50.4  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4318  conjugal transfer peptidase TraF  26.57 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.666269  normal  0.975126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3011  conjugal transfer protein precursor  22.29 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5167  putative conjugal transfer protein  23.44 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3080  conjugal transfer protein precursor  22.22 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0706  conjugal transfer protein precursor  23.7 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1819  plasmid transfer protein TraF  26.09 
 
 		 192 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0756  putative conjugal transfer protein precursor  22.22 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1605  conjugal transfer protein precursor  21.85 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3821  putative conjugal transfer protein precursor  20.13 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2802  conjugal transfer protein precursor  20 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0628  putative conjugal transfer protein TraF  22.22 
 
 		 220 aa  44.3  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2322  hypothetical protein  24.78 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0661618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7435  putative conjugal transfer protein precursor  25.32 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2342  conjugal transfer protein precursor  23.23 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0024  conjugal transfer peptidase TraF  25.49 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0928495  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3769  type IV secretory protease  23.36 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  24.29 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0684  conjugal transfer protein precursor  24.68 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  19.63 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0519  TraF peptidase  18.24 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19802  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3189  conjugal transfer protein precursor  19.44 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.110691  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5335  conjugal transfer protein TraF  23.62 
 
 		 179 aa  40.8  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0182  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  17.78 
 
 		 147 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>