85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0706 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0706  conjugal transfer protein precursor  100 
 
 		 181 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3845  TraF peptidase  63.28 
 
 		 186 aa  234  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232277  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0136  hypothetical protein  59.89 
 
 		 310 aa  210  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3373  conjugal transfer protein precursor  59.67 
 
 		 188 aa  204  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3821  putative conjugal transfer protein precursor  58.56 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0849  conjugal transfer protein precursor  55.75 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3183  conjugal transfer protein precursor  63.35 
 
 		 200 aa  200  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1510  conjugal transfer protein precursor  55.49 
 
 		 180 aa  191  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0756  putative conjugal transfer protein precursor  55.8 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3556  conjugal transfer protein precursor  51.93 
 
 		 181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7735  putative conjugal transfer protein precursor  53.59 
 
 		 181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2333  TraF peptidase  56.57 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.530383  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2871  putative conjugal transfer protein precursor  53.59 
 
 		 181 aa  184  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4011  peptidase S26C conjugative transfer signal peptidase TraF  57.14 
 
 		 181 aa  177  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3189  conjugal transfer protein precursor  51.4 
 
 		 181 aa  177  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.110691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3011  conjugal transfer protein precursor  56.77 
 
 		 181 aa  177  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0585  conjugal transfer protein precursor  57.14 
 
 		 181 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.961115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3906  conjugal transfer protein precursor  51.19 
 
 		 171 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2802  conjugal transfer protein precursor  52.35 
 
 		 181 aa  175  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0519  TraF peptidase  49.17 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19802  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3080  conjugal transfer protein precursor  51.38 
 
 		 181 aa  171  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3535  conjugal transfer protein precursor  48.62 
 
 		 181 aa  167  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1200  conjugal transfer protein precursor  48.62 
 
 		 181 aa  167  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7435  putative conjugal transfer protein precursor  57.45 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3349  putative conjugal transfer protein (traF)  52.82 
 
 		 171 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.920518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1605  conjugal transfer protein precursor  55.1 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1030  putative conjugal transfer protein TraF  49.36 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.201544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3685  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  53.24 
 
 		 192 aa  147  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2622  conjugal transfer protein traF  48.3 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2493  conjugal transfer protein traF  43.82 
 
 		 196 aa  137  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.955009 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0978  putative conjugal transfer protein TraF  44.85 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0362  conjugal transfer protein precursor  44.44 
 
 		 192 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0182  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  42.45 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2015  conjugal transfer protein TraF  40.27 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.494735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2250  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  45.77 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1819  plasmid transfer protein TraF  41.14 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2658  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  36.24 
 
 		 199 aa  90.9  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35940  conjugative transfer signal peptidase TraF  36.24 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1258  TraF peptidase  35.33 
 
 		 195 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1882  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  35.57 
 
 		 199 aa  88.6  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.760081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31080  putative conjugal transfer protein  37.68 
 
 		 191 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000439083  unclonable  1.40338e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1292  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  36.05 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3521  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  36.67 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1267  TraF peptidase  32.89 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0454  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  35.33 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1988  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  35.33 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2333  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  34.9 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  33.12 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2929  TraF peptidase  34.67 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3727  conjugal transfer protein  33.33 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1488  TraF peptidase  34.67 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2624  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  33.33 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0317965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2090  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  33.33 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2342  conjugal transfer protein precursor  30.92 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5335  conjugal transfer protein TraF  28.38 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2717  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  32.67 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.378088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3020  TraF peptidase  32.67 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0690  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  32.57 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4170  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  30.56 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2602  conjugal transfer TraF transmembrane protein  32.21 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2356  conjugal transfer protein TraF  32.14 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7065  conjugal transfer pilin processing protease TraF  36.47 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0628  putative conjugal transfer protein TraF  33.33 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9191  conjugal transfer pilin processing protease TraF  33.15 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5167  putative conjugal transfer protein  30.41 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0684  conjugal transfer protein precursor  30.94 
 
 		 193 aa  62  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4541  conjugal transfer pilin processing protease TraF  32.57 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.708935  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8132  conjugal transfer pilin processing protease TraF  33.33 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.562058  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4714  conjugative transfer signal peptidase TraF  27.97 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0276  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  28.57 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4318  conjugal transfer peptidase TraF  31.76 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.666269  normal  0.975126 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0913  signal peptidase I  29.31 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0872445  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1613  Peptidase S26, conserved region  26.4 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1416  conjugal transfer protein precursor  29.61 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5513  conjugal transfer pilin processing protease TraF  33.33 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0619893 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5392  conjugal transfer pilin processing protease TraF  35.77 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1726  conjugal transfer protein TraF, putative  29.61 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0878  hypothetical protein  23.7 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9596  conjugal transfer pilin processing protease TraF  33.1 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6613  conjugal transfer peptidase TraF  32.43 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6524  conjugal transfer peptidase TraF  32.43 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897542  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  28.82 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  27.35 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  28.93 
 
 		 262 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0024  conjugal transfer peptidase TraF  26.03 
 
 		 174 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0928495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>