91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9596 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9596  conjugal transfer pilin processing protease TraF  100 
 
 		 177 aa  351  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4541  conjugal transfer pilin processing protease TraF  52.84 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.708935  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7065  conjugal transfer pilin processing protease TraF  54.71 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8132  conjugal transfer pilin processing protease TraF  52.47 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.562058  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5392  conjugal transfer pilin processing protease TraF  49.1 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5513  conjugal transfer pilin processing protease TraF  53.29 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0619893 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9191  conjugal transfer pilin processing protease TraF  46.55 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4714  conjugative transfer signal peptidase TraF  34.75 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1613  Peptidase S26, conserved region  37.99 
 
 		 177 aa  84.3  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2333  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  38.71 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2622  conjugal transfer protein traF  37.5 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2247  conjugal transfer peptidase TraF  29.48 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3727  conjugal transfer protein  38.06 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4318  conjugal transfer peptidase TraF  31.54 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.666269  normal  0.975126 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3521  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  36.67 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1988  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  37.42 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0849  conjugal transfer protein precursor  33.15 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1292  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  37.11 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2015  conjugal transfer protein TraF  36.43 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.494735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2342  conjugal transfer protein precursor  31.71 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3080  conjugal transfer protein precursor  39.02 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2493  conjugal transfer protein traF  38.19 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.955009 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2250  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  37.67 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1258  TraF peptidase  35.85 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2356  conjugal transfer protein TraF  33.55 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2717  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  36.11 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.378088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3685  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  36.49 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0690  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  40 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3020  TraF peptidase  36.11 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3189  conjugal transfer protein precursor  36.55 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.110691  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0024  conjugal transfer peptidase TraF  27.27 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0928495  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2602  conjugal transfer TraF transmembrane protein  39.87 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2658  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  35.85 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1862 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2624  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  43.69 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0317965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1030  putative conjugal transfer protein TraF  39.86 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.201544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3821  putative conjugal transfer protein precursor  41.18 
 
 		 181 aa  62  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2333  TraF peptidase  36.55 
 
 		 181 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.530383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0454  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  33.96 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1488  TraF peptidase  38.56 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0978  putative conjugal transfer protein TraF  38.18 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1510  conjugal transfer protein precursor  31.76 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3556  conjugal transfer protein precursor  40.91 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0362  conjugal transfer protein precursor  37.93 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0182  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  33.79 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1882  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  36.48 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.760081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0585  conjugal transfer protein precursor  33.56 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.961115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4011  peptidase S26C conjugative transfer signal peptidase TraF  34 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6524  conjugal transfer peptidase TraF  30.87 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0756  putative conjugal transfer protein precursor  39.45 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6613  conjugal transfer peptidase TraF  30.87 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  34.53 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7735  putative conjugal transfer protein precursor  36.49 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2531  conjugal transfer protein TraF  38.14 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400646  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2929  TraF peptidase  35.22 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3349  putative conjugal transfer protein (traF)  31.36 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.920518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2871  putative conjugal transfer protein precursor  35.33 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3845  TraF peptidase  33.33 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232277  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35940  conjugative transfer signal peptidase TraF  34.59 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4170  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  31.61 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3011  conjugal transfer protein precursor  33.79 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5335  conjugal transfer protein TraF  36.67 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31080  putative conjugal transfer protein  35.03 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000439083  unclonable  1.40338e-22 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2090  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  32.24 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7435  putative conjugal transfer protein precursor  31.36 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2802  conjugal transfer protein precursor  39.22 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0136  hypothetical protein  32.72 
 
 		 310 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3906  conjugal transfer protein precursor  29.38 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1267  TraF peptidase  32.08 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1605  conjugal transfer protein precursor  35.86 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3373  conjugal transfer protein precursor  32.34 
 
 		 188 aa  51.2  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0519  TraF peptidase  34.48 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19802  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1200  conjugal transfer protein precursor  36.19 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3535  conjugal transfer protein precursor  36.19 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1819  plasmid transfer protein TraF  35.4 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3183  conjugal transfer protein precursor  31.01 
 
 		 200 aa  48.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0246  type IV secretory protease  26.47 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0706  conjugal transfer protein precursor  33.1 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0276  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  27.54 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  31.73 
 
 		 341 aa  45.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5167  putative conjugal transfer protein  31.72 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  28 
 
 		 215 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0684  conjugal transfer protein precursor  28.66 
 
 		 193 aa  44.7  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1416  conjugal transfer protein precursor  30 
 
 		 181 aa  44.3  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1111  signal peptidase I  35.96 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305344  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1726  conjugal transfer protein TraF, putative  31.62 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0184  signal peptidase I  28.08 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  31.91 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3710  signal peptidase I  32.14 
 
 		 272 aa  43.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0913  signal peptidase I  34.88 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0872445  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1091  conjugation signal peptidase TraF, putative  31.68 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  35.48 
 
 		 214 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>