69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0246 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0246  type IV secretory protease  100 
 
 		 164 aa  340  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0308  type IV secretory protease  78.66 
 
 		 164 aa  283  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3769  type IV secretory protease  42.75 
 
 		 128 aa  121  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2165  Type IV secretory pathway protease TraF-like  33.09 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0937  putative type IV secretory protease  41.46 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.320644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  33.55 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6223  hypothetical protein  32.26 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2322  hypothetical protein  32.06 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0661618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2342  conjugal transfer protein precursor  27.92 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2655  hypothetical protein  32.06 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.364147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  34 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0684  conjugal transfer protein precursor  28.83 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  31.43 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0628  putative conjugal transfer protein TraF  27.27 
 
 		 220 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0373  putative pilus assembly protein, TrhF  25.95 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1533  hypothetical protein  30.88 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0097  type IV conjugative transfer system signal peptidase  22.93 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.120482 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5374  type IV secretory pathway protease TraF-like protein  31.18 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.705949 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4541  conjugal transfer pilin processing protease TraF  35.23 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.708935  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  30.46 
 
 		 198 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  25.45 
 
 		 190 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9596  conjugal transfer pilin processing protease TraF  26.47 
 
 		 177 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  28.29 
 
 		 199 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  30.56 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2062  Signal peptidase I  28.18 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0513  signal peptidase I  31.33 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.124665  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  30.56 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  33.05 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  27.59 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  30 
 
 		 222 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  26.11 
 
 		 183 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  28.32 
 
 		 214 aa  44.7  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  32.61 
 
 		 199 aa  44.7  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  51.35 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  35.63 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  35.8 
 
 		 288 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1091  conjugation signal peptidase TraF, putative  21.6 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  28.21 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  27.34 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  25.87 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  28.95 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  30.7 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  30.19 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  28.44 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  28.57 
 
 		 267 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  27.64 
 
 		 301 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  28.18 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  28.19 
 
 		 225 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  27.01 
 
 		 189 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  27.35 
 
 		 271 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  24.06 
 
 		 183 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  27.45 
 
 		 200 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3710  signal peptidase I  23.48 
 
 		 272 aa  41.6  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  23.53 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  23.53 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  32.46 
 
 		 226 aa  41.6  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  23.53 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  23.53 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  23.53 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  23.53 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  28.86 
 
 		 225 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  24.16 
 
 		 184 aa  41.2  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  23.53 
 
 		 183 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  24.26 
 
 		 183 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  29.33 
 
 		 221 aa  40.8  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  25 
 
 		 188 aa  40.8  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  42 
 
 		 299 aa  40.8  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1935  signal peptidase I  27.14 
 
 		 201 aa  40.4  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6803  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  29.77 
 
 		 169 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>