94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2871 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2871  putative conjugal transfer protein precursor  100 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0756  putative conjugal transfer protein precursor  85.08 
 
 		 181 aa  318  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7735  putative conjugal transfer protein precursor  70.72 
 
 		 181 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0519  TraF peptidase  68.51 
 
 		 181 aa  256  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19802  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3821  putative conjugal transfer protein precursor  67.4 
 
 		 181 aa  254  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3556  conjugal transfer protein precursor  63.54 
 
 		 181 aa  243  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2333  TraF peptidase  63.33 
 
 		 181 aa  237  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.530383  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3011  conjugal transfer protein precursor  63.54 
 
 		 181 aa  235  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3535  conjugal transfer protein precursor  61.96 
 
 		 181 aa  234  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1200  conjugal transfer protein precursor  61.96 
 
 		 181 aa  234  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4011  peptidase S26C conjugative transfer signal peptidase TraF  61.33 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0585  conjugal transfer protein precursor  60.22 
 
 		 181 aa  228  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.961115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1605  conjugal transfer protein precursor  63.07 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3080  conjugal transfer protein precursor  62.98 
 
 		 181 aa  222  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3189  conjugal transfer protein precursor  58.01 
 
 		 181 aa  214  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.110691  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2802  conjugal transfer protein precursor  56.67 
 
 		 181 aa  210  7e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0136  hypothetical protein  56.74 
 
 		 310 aa  197  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3373  conjugal transfer protein precursor  57.8 
 
 		 188 aa  195  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1510  conjugal transfer protein precursor  54.1 
 
 		 180 aa  194  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3183  conjugal transfer protein precursor  59.01 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3845  TraF peptidase  54.88 
 
 		 186 aa  187  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232277  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1030  putative conjugal transfer protein TraF  57.58 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.201544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0706  conjugal transfer protein precursor  53.59 
 
 		 181 aa  184  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7435  putative conjugal transfer protein precursor  53.7 
 
 		 163 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0978  putative conjugal transfer protein TraF  54.22 
 
 		 209 aa  177  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3906  conjugal transfer protein precursor  53.05 
 
 		 171 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2493  conjugal transfer protein traF  49.42 
 
 		 196 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.955009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3349  putative conjugal transfer protein (traF)  52.48 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.920518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3685  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  57.55 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0849  conjugal transfer protein precursor  53.52 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0362  conjugal transfer protein precursor  51.63 
 
 		 192 aa  148  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2622  conjugal transfer protein traF  50 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0182  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  51.03 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1292  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  47.06 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31080  putative conjugal transfer protein  47.92 
 
 		 191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000439083  unclonable  1.40338e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1882  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  45.51 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.760081  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1258  TraF peptidase  44.87 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2658  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  44.52 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0454  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  43.59 
 
 		 195 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35940  conjugative transfer signal peptidase TraF  43.95 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1267  TraF peptidase  42.31 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3727  conjugal transfer protein  45.1 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2333  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  44.52 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1488  TraF peptidase  45.51 
 
 		 195 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1988  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  43.23 
 
 		 195 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2015  conjugal transfer protein TraF  43.57 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.494735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3521  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  44.87 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2929  TraF peptidase  43.51 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0690  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  44.52 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2624  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  43.59 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0317965  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2602  conjugal transfer TraF transmembrane protein  43.23 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2717  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  44.23 
 
 		 195 aa  110  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.378088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3020  TraF peptidase  44.23 
 
 		 195 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1819  plasmid transfer protein TraF  41.03 
 
 		 192 aa  107  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4170  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  40.52 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2250  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  48.25 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2090  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  41.13 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5335  conjugal transfer protein TraF  33.56 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5167  putative conjugal transfer protein  38.57 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0628  putative conjugal transfer protein TraF  33.53 
 
 		 220 aa  80.9  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2342  conjugal transfer protein precursor  33.57 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0684  conjugal transfer protein precursor  30.3 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2356  conjugal transfer protein TraF  31.16 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  30.49 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8132  conjugal transfer pilin processing protease TraF  32.95 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.562058  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7065  conjugal transfer pilin processing protease TraF  35.42 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1726  conjugal transfer protein TraF, putative  31.82 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4714  conjugative transfer signal peptidase TraF  30.07 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1416  conjugal transfer protein precursor  30.52 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0276  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  29.87 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9596  conjugal transfer pilin processing protease TraF  35.33 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0878  hypothetical protein  23.53 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9191  conjugal transfer pilin processing protease TraF  31.97 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1613  Peptidase S26, conserved region  29.61 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6524  conjugal transfer peptidase TraF  31.51 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897542  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6613  conjugal transfer peptidase TraF  31.51 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4541  conjugal transfer pilin processing protease TraF  33.79 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.708935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2531  conjugal transfer protein TraF  29.73 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400646  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4318  conjugal transfer peptidase TraF  29.17 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.666269  normal  0.975126 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  31.21 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5392  conjugal transfer pilin processing protease TraF  34.69 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1172  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  20.74 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0913  signal peptidase I  40.24 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0872445  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2247  conjugal transfer peptidase TraF  27.78 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1111  signal peptidase I  36.14 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305344  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  29.71 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  28.37 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  27.68 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5513  conjugal transfer pilin processing protease TraF  33.33 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0619893 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  28.57 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  30.11 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1523  signal peptidase I  26.32 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000512014  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0024  conjugal transfer peptidase TraF  28.77 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0928495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  25 
 
 		 183 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>