33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1172 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1172  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  100 
 
 		 155 aa  295  2e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0878  hypothetical protein  67.55 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4714  conjugative transfer signal peptidase TraF  27.04 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3080  conjugal transfer protein precursor  26.85 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3011  conjugal transfer protein precursor  23.08 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0024  conjugal transfer peptidase TraF  30.36 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0928495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1819  plasmid transfer protein TraF  24.24 
 
 		 192 aa  51.2  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2247  conjugal transfer peptidase TraF  25 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4318  conjugal transfer peptidase TraF  26.57 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.666269  normal  0.975126 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2622  conjugal transfer protein traF  22.07 
 
 		 199 aa  48.5  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3373  conjugal transfer protein precursor  22.49 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0756  putative conjugal transfer protein precursor  23.7 
 
 		 181 aa  47.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2871  putative conjugal transfer protein precursor  20.74 
 
 		 181 aa  47.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5335  conjugal transfer protein TraF  24.22 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2356  conjugal transfer protein TraF  25 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1605  conjugal transfer protein precursor  21.19 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0628  putative conjugal transfer protein TraF  22.98 
 
 		 220 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5167  putative conjugal transfer protein  22.66 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2140  signal peptidase I  33.7 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  23.81 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3556  conjugal transfer protein precursor  22.58 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3183  conjugal transfer protein precursor  21.48 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  23.62 
 
 		 264 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4176  hypothetical protein  20.86 
 
 		 158 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0912221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  31.78 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1533  hypothetical protein  22.81 
 
 		 194 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  28.57 
 
 		 173 aa  41.2  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  29.82 
 
 		 216 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  26.96 
 
 		 219 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3821  putative conjugal transfer protein precursor  21.71 
 
 		 181 aa  40.8  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0373  putative pilus assembly protein, TrhF  21.37 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  24.32 
 
 		 271 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  33.33 
 
 		 178 aa  40.4  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>