More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1570 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  100 
 
 		 1093 aa  2237    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  38.46 
 
 		 907 aa  479  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  41.94 
 
 		 1039 aa  284  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  34.99 
 
 		 952 aa  283  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  34.73 
 
 		 952 aa  279  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  41.81 
 
 		 976 aa  277  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  41.81 
 
 		 976 aa  277  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  41.14 
 
 		 998 aa  276  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  41.05 
 
 		 1034 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  40.83 
 
 		 982 aa  274  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  41.05 
 
 		 985 aa  269  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  35.42 
 
 		 968 aa  267  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  38.62 
 
 		 974 aa  265  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  38.42 
 
 		 1000 aa  263  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  38.42 
 
 		 1000 aa  263  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  34.94 
 
 		 1098 aa  261  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  38.01 
 
 		 1025 aa  260  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  34.7 
 
 		 998 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  36.94 
 
 		 1105 aa  259  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  40.26 
 
 		 1034 aa  258  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  35.56 
 
 		 1098 aa  255  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  38.11 
 
 		 1356 aa  254  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  30.11 
 
 		 918 aa  251  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  33.78 
 
 		 1006 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  35.59 
 
 		 1102 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  37.08 
 
 		 1107 aa  244  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  35.03 
 
 		 1095 aa  243  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  37.39 
 
 		 1102 aa  240  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  37.61 
 
 		 1102 aa  239  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  38.28 
 
 		 1536 aa  238  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  37.95 
 
 		 1100 aa  237  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  38.2 
 
 		 1100 aa  237  8e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  38.78 
 
 		 1245 aa  237  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  37.95 
 
 		 814 aa  234  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  37.78 
 
 		 1107 aa  234  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  37.61 
 
 		 1123 aa  233  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  36.89 
 
 		 1557 aa  213  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  32.44 
 
 		 881 aa  208  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  25.42 
 
 		 1112 aa  203  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  37.07 
 
 		 1538 aa  199  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  31.95 
 
 		 879 aa  198  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  29.47 
 
 		 981 aa  187  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  37.18 
 
 		 1534 aa  180  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  27.7 
 
 		 1170 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  26.68 
 
 		 961 aa  175  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  28.47 
 
 		 929 aa  171  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  27.28 
 
 		 964 aa  170  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  28.7 
 
 		 1836 aa  169  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  29.11 
 
 		 1175 aa  168  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5396  TrwC relaxase  27 
 
 		 1623 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.348117 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  27.27 
 
 		 944 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1944  conjugative relaxase domain-containing protein  26.33 
 
 		 910 aa  165  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  27.97 
 
 		 1523 aa  162  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  27.97 
 
 		 1523 aa  162  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  25.81 
 
 		 1665 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  28.84 
 
 		 1168 aa  157  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  25.86 
 
 		 946 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  25.84 
 
 		 943 aa  157  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  26.4 
 
 		 945 aa  156  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  26.92 
 
 		 1976 aa  154  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  26.58 
 
 		 1967 aa  153  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  33.79 
 
 		 1184 aa  152  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  27.57 
 
 		 936 aa  149  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3254  exonuclease V subunit alpha  26.71 
 
 		 1529 aa  149  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  26.27 
 
 		 2090 aa  144  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  32.78 
 
 		 1174 aa  144  9e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3542  aldehyde dehydrogenase  26.39 
 
 		 1683 aa  143  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1469  TrwC relaxase  26.46 
 
 		 1189 aa  142  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137376  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8975  TrwC relaxase  27.78 
 
 		 1386 aa  140  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  22.93 
 
 		 870 aa  137  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  24.18 
 
 		 919 aa  137  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  26.94 
 
 		 1010 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  25.62 
 
 		 1797 aa  133  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  32.6 
 
 		 379 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3587  exonuclease V subunit alpha  27.22 
 
 		 1699 aa  132  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1453  TrwC relaxase  24.79 
 
 		 1223 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  32.31 
 
 		 1176 aa  130  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3226  aldehyde dehydrogenase  26.11 
 
 		 1681 aa  128  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1195  conjugative relaxase domain-containing protein  27.12 
 
 		 907 aa  124  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.844088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  30.22 
 
 		 926 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  26.87 
 
 		 1955 aa  122  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  24.1 
 
 		 1549 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  25.51 
 
 		 866 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  27.58 
 
 		 1952 aa  122  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1790  TrwC relaxase  35.5 
 
 		 322 aa  120  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428161  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  26.23 
 
 		 1481 aa  119  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6204  conjugative relaxase domain-containing protein  25.9 
 
 		 1087 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3227  conjugal transfer protein traA  35.93 
 
 		 267 aa  117  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  25.69 
 
 		 872 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0016  TrwC relaxase  27.46 
 
 		 926 aa  112  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  24.65 
 
 		 1035 aa  111  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4481  conjugative relaxase domain-containing protein  25.59 
 
 		 907 aa  111  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4614  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.52 
 
 		 1986 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.441431  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  30.82 
 
 		 982 aa  109  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2022  TrwC relaxase  25.94 
 
 		 1112 aa  110  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715735  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3692  TrwC relaxase  25.6 
 
 		 1068 aa  109  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.372056 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  23.56 
 
 		 1986 aa  108  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  23.56 
 
 		 1986 aa  107  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  24.8 
 
 		 1986 aa  107  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  24.38 
 
 		 1986 aa  106  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>