111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6204 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010070  Bmul_6204  conjugative relaxase domain-containing protein  100 
 
 		 1087 aa  2202    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  32.73 
 
 		 961 aa  179  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  32.48 
 
 		 964 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  31.74 
 
 		 929 aa  168  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  32.03 
 
 		 1010 aa  165  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  33.47 
 
 		 936 aa  161  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  31.77 
 
 		 923 aa  158  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  29.26 
 
 		 1035 aa  157  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  31.73 
 
 		 943 aa  151  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  30.67 
 
 		 1014 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2183  TrwC protein  31 
 
 		 542 aa  150  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  29.15 
 
 		 926 aa  141  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  28.13 
 
 		 1170 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3983  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1013 aa  127  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4614  conjugative transfer relaxase protein TraI  29.2 
 
 		 1986 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.441431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  29.2 
 
 		 1986 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  29.2 
 
 		 1986 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  29.2 
 
 		 1986 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  26.29 
 
 		 1093 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0010  conjugal transfer nickase/helicase TraI  29.75 
 
 		 1756 aa  112  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0549712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  28.61 
 
 		 1986 aa  111  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  28.91 
 
 		 1986 aa  111  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1944  conjugative relaxase domain-containing protein  27.86 
 
 		 910 aa  109  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_21  protein TraI (DNA helicase I)  26.55 
 
 		 1936 aa  107  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  24.45 
 
 		 1112 aa  103  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  25.56 
 
 		 1665 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  26.21 
 
 		 982 aa  102  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7342  conjugative relaxase domain protein  33.18 
 
 		 1486 aa  99.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.113583 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  33.47 
 
 		 1111 aa  97.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1955 aa  95.1  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  24.54 
 
 		 870 aa  91.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4481  conjugative relaxase domain-containing protein  33.33 
 
 		 907 aa  86.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4309  conjugal transfer nickase/helicase TraI  26.42 
 
 		 1807 aa  81.6  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1195  conjugative relaxase domain-containing protein  33.51 
 
 		 907 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.844088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  24.19 
 
 		 919 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2354  conjugative relaxase domain protein  25 
 
 		 1351 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  30 
 
 		 907 aa  78.2  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  26.48 
 
 		 1797 aa  73.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  27.7 
 
 		 1836 aa  70.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1790  TrwC relaxase  28.51 
 
 		 322 aa  67.8  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428161  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  25.4 
 
 		 918 aa  67.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  33.99 
 
 		 998 aa  65.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0253  TrwC relaxase  30.51 
 
 		 957 aa  65.1  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  31.15 
 
 		 379 aa  64.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  33.65 
 
 		 1034 aa  63.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0576  TrwC relaxase  33.17 
 
 		 669 aa  63.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230411  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  34.12 
 
 		 985 aa  62.4  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  34 
 
 		 1039 aa  61.6  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4256  TrwC relaxase  29.52 
 
 		 1026 aa  60.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  26.24 
 
 		 881 aa  60.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  32.7 
 
 		 998 aa  60.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  32.04 
 
 		 976 aa  60.1  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  32.04 
 
 		 976 aa  60.1  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  26.24 
 
 		 879 aa  59.7  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  32.55 
 
 		 1000 aa  59.3  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  32.55 
 
 		 1000 aa  59.3  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  25.35 
 
 		 1980 aa  57.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  29.07 
 
 		 1175 aa  57.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3338  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1520 aa  57  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.389694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  30.81 
 
 		 1034 aa  57.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  33.18 
 
 		 968 aa  56.2  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0077  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.43 
 
 		 1428 aa  55.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  31.94 
 
 		 1006 aa  53.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  27.95 
 
 		 944 aa  53.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  28.74 
 
 		 1549 aa  52.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  30 
 
 		 952 aa  52.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  28.38 
 
 		 945 aa  51.6  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  30 
 
 		 952 aa  52  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  26.77 
 
 		 1967 aa  50.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  28.38 
 
 		 946 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  30.05 
 
 		 982 aa  51.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  29.41 
 
 		 1176 aa  51.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  22.17 
 
 		 1123 aa  51.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  36.26 
 
 		 1536 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  29.24 
 
 		 974 aa  50.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  24.47 
 
 		 1523 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  24.47 
 
 		 1523 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  34.43 
 
 		 747 aa  48.9  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  27.02 
 
 		 1174 aa  48.9  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3254  exonuclease V subunit alpha  27.59 
 
 		 1529 aa  48.9  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3692  TrwC relaxase  27.2 
 
 		 1068 aa  48.5  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.372056 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  31.06 
 
 		 784 aa  48.9  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  36.94 
 
 		 1231 aa  48.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.47 
 
 		 1105 aa  47.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  28.99 
 
 		 754 aa  47.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  30.43 
 
 		 725 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  25.81 
 
 		 1184 aa  47  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3374  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.97 
 
 		 616 aa  46.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.75 
 
 		 1538 aa  46.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  28.79 
 
 		 778 aa  46.2  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  27.63 
 
 		 981 aa  46.2  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  29.33 
 
 		 1025 aa  46.2  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5396  TrwC relaxase  29.82 
 
 		 1623 aa  46.2  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.348117 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.79 
 
 		 778 aa  45.8  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  37.66 
 
 		 1557 aa  46.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  28.79 
 
 		 778 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  27.63 
 
 		 786 aa  46.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  28.79 
 
 		 778 aa  45.8  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.79 
 
 		 778 aa  45.8  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  28.79 
 
 		 770 aa  45.8  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>