More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1152 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  62.41 
 
 		 985 aa  1117    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  64.92 
 
 		 968 aa  1148    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  61.1 
 
 		 814 aa  931    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  57.56 
 
 		 1000 aa  1031    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  57.56 
 
 		 1000 aa  1031    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  62.18 
 
 		 1034 aa  1151    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  60.22 
 
 		 1034 aa  1083    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  61.72 
 
 		 998 aa  1138    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  59.98 
 
 		 1006 aa  1077    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  60.77 
 
 		 1039 aa  1135    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  63.12 
 
 		 974 aa  1173    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  51.87 
 
 		 1025 aa  887    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  63.63 
 
 		 976 aa  1159    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  61.89 
 
 		 982 aa  1129    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  61.12 
 
 		 998 aa  1119    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  94.37 
 
 		 952 aa  1769    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  63.63 
 
 		 976 aa  1159    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  100 
 
 		 952 aa  1893    Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  41.28 
 
 		 1102 aa  554  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  40.9 
 
 		 1102 aa  552  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  40.63 
 
 		 1123 aa  539  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  41.33 
 
 		 1100 aa  542  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  40.38 
 
 		 1100 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  40.62 
 
 		 1107 aa  536  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  41.16 
 
 		 1098 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  42.64 
 
 		 1102 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  41.35 
 
 		 1095 aa  532  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  41.16 
 
 		 1098 aa  529  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  40.61 
 
 		 1107 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  40.2 
 
 		 1105 aa  515  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  40.9 
 
 		 1356 aa  489  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  40.72 
 
 		 1245 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  39.57 
 
 		 1557 aa  468  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  38.71 
 
 		 1536 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3228  MobA/MobL protein  63.75 
 
 		 447 aa  445  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  39.72 
 
 		 1538 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  38.07 
 
 		 1534 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  34.28 
 
 		 881 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  33.47 
 
 		 879 aa  402  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  34.25 
 
 		 1168 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  37.89 
 
 		 907 aa  299  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3227  conjugal transfer protein traA  64.25 
 
 		 267 aa  286  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  34.31 
 
 		 1093 aa  268  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5425  MobA/MobL protein  44.19 
 
 		 379 aa  226  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.369959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  33.01 
 
 		 918 aa  217  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  46.67 
 
 		 719 aa  213  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  39.41 
 
 		 730 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  40.6 
 
 		 726 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1788  MobA/MobL protein  30.52 
 
 		 544 aa  184  6e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.96066  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5332  MobA/MobL protein  46.26 
 
 		 498 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.873373 
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3630  MobA/MobL protein  40.24 
 
 		 361 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1747  MobA/MobL protein  40.4 
 
 		 465 aa  164  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2314  MobA/MobL family protein  37.31 
 
 		 506 aa  156  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127773  hitchhiker  0.00000000000117095 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  31.8 
 
 		 981 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2074  MobA/MobL family  36.82 
 
 		 501 aa  151  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.103874  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D28  hypothetical protein  33.84 
 
 		 673 aa  144  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00718795  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5162  MobA/MobL protein  38.08 
 
 		 498 aa  140  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  35.08 
 
 		 1184 aa  138  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  33.18 
 
 		 1174 aa  136  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  33.68 
 
 		 1176 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  30.09 
 
 		 1481 aa  128  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  29.62 
 
 		 1231 aa  127  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4998  MobA/MobL protein  35.94 
 
 		 766 aa  124  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  31.57 
 
 		 1175 aa  121  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5348  mobilization protein  37.82 
 
 		 407 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  31.09 
 
 		 1967 aa  118  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  32.31 
 
 		 1836 aa  116  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  29.77 
 
 		 1976 aa  115  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  27.63 
 
 		 1797 aa  111  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  29.63 
 
 		 1170 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  33.24 
 
 		 926 aa  108  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3542  aldehyde dehydrogenase  29.7 
 
 		 1683 aa  108  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311883  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0463  MobA/MobL protein  39.21 
 
 		 467 aa  106  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.0604865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4107  MobA/MobL protein  29.36 
 
 		 310 aa  105  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.372473 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3226  aldehyde dehydrogenase  29.59 
 
 		 1681 aa  103  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1469  TrwC relaxase  28.54 
 
 		 1189 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137376  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3587  exonuclease V subunit alpha  28.6 
 
 		 1699 aa  100  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246341 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  26.64 
 
 		 1980 aa  100  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  29.11 
 
 		 1955 aa  100  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  26 
 
 		 1549 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7342  conjugative relaxase domain protein  26.52 
 
 		 1486 aa  99  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.113583 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  25.51 
 
 		 961 aa  98.6  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  28.3 
 
 		 1952 aa  98.6  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  26.27 
 
 		 710 aa  95.9  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  28.85 
 
 		 872 aa  96.3  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8975  TrwC relaxase  28.84 
 
 		 1386 aa  95.5  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5396  TrwC relaxase  28.61 
 
 		 1623 aa  95.5  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.348117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  28.41 
 
 		 1523 aa  94.7  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  28.41 
 
 		 1523 aa  94.7  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  30.7 
 
 		 945 aa  94  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  29.22 
 
 		 866 aa  92.8  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  26.98 
 
 		 929 aa  92.4  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  31.55 
 
 		 944 aa  90.9  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  27.01 
 
 		 2090 aa  90.9  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  27.71 
 
 		 1665 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  28.54 
 
 		 637 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  29.76 
 
 		 728 aa  89  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  28.64 
 
 		 733 aa  89  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  29.24 
 
 		 964 aa  89  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  26.58 
 
 		 728 aa  87.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>