219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5390 on replicon NC_011880
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  100 
 
 		 1665 aa  3408    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  30.38 
 
 		 1170 aa  348  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  28.86 
 
 		 961 aa  327  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  30.99 
 
 		 936 aa  295  7e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  30.59 
 
 		 943 aa  288  5e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  28.83 
 
 		 929 aa  280  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  28.07 
 
 		 964 aa  275  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  26.98 
 
 		 982 aa  257  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  29.14 
 
 		 923 aa  252  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  34.11 
 
 		 926 aa  232  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  27.12 
 
 		 1010 aa  231  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3983  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1013 aa  213  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0025  hypothetical protein  37.3 
 
 		 1194 aa  212  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.204228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  24.16 
 
 		 870 aa  202  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  25.06 
 
 		 1112 aa  198  8.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1195  conjugative relaxase domain-containing protein  27.32 
 
 		 907 aa  196  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.844088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  24.91 
 
 		 919 aa  194  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4481  conjugative relaxase domain-containing protein  27.1 
 
 		 907 aa  192  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1944  conjugative relaxase domain-containing protein  26.38 
 
 		 910 aa  188  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  32.02 
 
 		 1035 aa  175  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7342  conjugative relaxase domain protein  29.45 
 
 		 1486 aa  171  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.113583 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1111 aa  154  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2179  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1010 aa  152  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019283 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  25.99 
 
 		 1093 aa  150  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1066  hypothetical protein  33.54 
 
 		 1015 aa  149  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619549  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1955 aa  148  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2183  TrwC protein  27.8 
 
 		 542 aa  147  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964158  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5473  hypothetical protein  33.84 
 
 		 1114 aa  145  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.467574 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  26.69 
 
 		 1014 aa  144  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5632  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1138 aa  143  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000206849 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0281  hypothetical protein  34.25 
 
 		 1065 aa  140  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1772  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1039 aa  139  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2115  hypothetical protein  33.01 
 
 		 1009 aa  139  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2159  hypothetical protein  33.01 
 
 		 1009 aa  139  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135027  normal  0.649366 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0059  DNA helicase  26.25 
 
 		 875 aa  135  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0011  hypothetical protein  33.12 
 
 		 1227 aa  133  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0010  conjugal transfer nickase/helicase TraI  37.4 
 
 		 1756 aa  130  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0549712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2354  conjugative relaxase domain protein  25 
 
 		 1351 aa  129  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  24.36 
 
 		 907 aa  126  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0027  putative protein traI  26.18 
 
 		 612 aa  124  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.483518  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4309  conjugal transfer nickase/helicase TraI  23.47 
 
 		 1807 aa  124  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  24.2 
 
 		 1986 aa  123  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  25.9 
 
 		 918 aa  123  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  24.02 
 
 		 1986 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  24.02 
 
 		 1986 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4775  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1034 aa  121  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527155  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4614  conjugative transfer relaxase protein TraI  24.2 
 
 		 1986 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.441431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  23.91 
 
 		 1986 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  24.02 
 
 		 1986 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_21  protein TraI (DNA helicase I)  29.48 
 
 		 1936 aa  120  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  25.24 
 
 		 981 aa  117  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5420  hypothetical protein  31 
 
 		 1170 aa  113  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  31.33 
 
 		 812 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  26.87 
 
 		 1175 aa  107  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6204  conjugative relaxase domain-containing protein  25.56 
 
 		 1087 aa  103  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  27.97 
 
 		 998 aa  103  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  23.37 
 
 		 1174 aa  103  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  27.59 
 
 		 968 aa  102  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  27.57 
 
 		 1039 aa  102  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  26.92 
 
 		 1231 aa  100  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  28.88 
 
 		 976 aa  100  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  28.88 
 
 		 976 aa  100  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0078  hypothetical protein  34.36 
 
 		 962 aa  100  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.253673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  26.6 
 
 		 1836 aa  99.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0077  conjugative transfer relaxase protein TraI  23.98 
 
 		 1428 aa  99  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  29.71 
 
 		 985 aa  99.4  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  30.25 
 
 		 982 aa  96.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  29.32 
 
 		 1034 aa  94.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.83 
 
 		 1356 aa  94  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  27.44 
 
 		 1000 aa  94.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  27.44 
 
 		 1000 aa  94.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  26.53 
 
 		 1107 aa  94  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5799  mobilization protein TraI-like protein  29.01 
 
 		 370 aa  94  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  29 
 
 		 1034 aa  93.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  28.5 
 
 		 974 aa  93.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  26.87 
 
 		 1523 aa  93.2  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  26.87 
 
 		 1523 aa  93.2  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  24.16 
 
 		 881 aa  92.4  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  26.83 
 
 		 952 aa  92.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  25.12 
 
 		 879 aa  91.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  32.83 
 
 		 379 aa  90.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  30.37 
 
 		 1006 aa  89.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  27.71 
 
 		 952 aa  89.4  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0044  hypothetical protein  31.96 
 
 		 967 aa  87.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5286  hypothetical protein  30.54 
 
 		 971 aa  87.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.55512  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5619  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1003 aa  85.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  26.73 
 
 		 1797 aa  84  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3254  exonuclease V subunit alpha  24.8 
 
 		 1529 aa  84  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  26.42 
 
 		 814 aa  84  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  29.85 
 
 		 998 aa  83.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  24.89 
 
 		 1557 aa  83.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  23.47 
 
 		 946 aa  83.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  24.22 
 
 		 1107 aa  82  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  25.25 
 
 		 944 aa  82  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3587  exonuclease V subunit alpha  24.61 
 
 		 1699 aa  82  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3227  conjugal transfer protein traA  30 
 
 		 267 aa  81.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  24.81 
 
 		 1952 aa  80.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  25.51 
 
 		 1955 aa  80.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  23.98 
 
 		 2090 aa  79.7  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  24.16 
 
 		 1105 aa  79.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>