More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0442 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  79.35 
 
 		 976 aa  1514    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  100 
 
 		 985 aa  1954    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  79.35 
 
 		 976 aa  1514    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  49.95 
 
 		 1025 aa  842    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  62.55 
 
 		 952 aa  1140    Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  71.1 
 
 		 1000 aa  1334    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  71.1 
 
 		 1000 aa  1334    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  76.05 
 
 		 1034 aa  1490    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  62.06 
 
 		 952 aa  1134    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  74.93 
 
 		 1034 aa  1426    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  76.45 
 
 		 998 aa  1493    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  73.93 
 
 		 1006 aa  1402    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  76.37 
 
 		 1039 aa  1498    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  75 
 
 		 968 aa  1396    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  59.84 
 
 		 974 aa  1117    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  77.69 
 
 		 982 aa  1494    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  75.55 
 
 		 998 aa  1423    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  65.99 
 
 		 814 aa  914    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3228  MobA/MobL protein  78.34 
 
 		 447 aa  545  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  41.15 
 
 		 1100 aa  531  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  40.23 
 
 		 1102 aa  528  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  40.1 
 
 		 1102 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  40.48 
 
 		 1107 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  42.01 
 
 		 1102 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  40.2 
 
 		 1105 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  39.74 
 
 		 1107 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  38.37 
 
 		 1098 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  38.59 
 
 		 1095 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  39.43 
 
 		 1100 aa  508  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  41.8 
 
 		 1098 aa  509  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  39.27 
 
 		 1123 aa  508  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  40.24 
 
 		 1356 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  41.18 
 
 		 1245 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  39.29 
 
 		 1557 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  37.96 
 
 		 1536 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  38.4 
 
 		 1538 aa  449  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  38.15 
 
 		 1534 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  33.56 
 
 		 881 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  33.2 
 
 		 879 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  35.33 
 
 		 1168 aa  347  8.999999999999999e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3227  conjugal transfer protein traA  79.64 
 
 		 267 aa  344  5e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  38.46 
 
 		 907 aa  289  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  41.05 
 
 		 1093 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  31.01 
 
 		 918 aa  196  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  41.28 
 
 		 730 aa  188  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  45.53 
 
 		 719 aa  187  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1788  MobA/MobL protein  37.31 
 
 		 544 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.96066  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5425  MobA/MobL protein  38.07 
 
 		 379 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.369959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  40 
 
 		 726 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5332  MobA/MobL protein  42.74 
 
 		 498 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.873373 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1747  MobA/MobL protein  42.42 
 
 		 465 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3630  MobA/MobL protein  43.94 
 
 		 361 aa  157  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  33.33 
 
 		 981 aa  152  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2314  MobA/MobL family protein  40.5 
 
 		 506 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127773  hitchhiker  0.00000000000117095 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5162  MobA/MobL protein  41.25 
 
 		 498 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2074  MobA/MobL family  41 
 
 		 501 aa  149  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.103874  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D28  hypothetical protein  32.58 
 
 		 673 aa  144  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00718795  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  33.25 
 
 		 1184 aa  135  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  32.63 
 
 		 1174 aa  135  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  33.86 
 
 		 1176 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  23.56 
 
 		 1112 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5348  mobilization protein  34.38 
 
 		 407 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4998  MobA/MobL protein  36.55 
 
 		 766 aa  125  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  29.23 
 
 		 1836 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  29.6 
 
 		 1797 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3542  aldehyde dehydrogenase  30.54 
 
 		 1683 aa  118  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  31.9 
 
 		 1175 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  28.68 
 
 		 1481 aa  115  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  28.94 
 
 		 1967 aa  114  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  27.57 
 
 		 1549 aa  114  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  29.22 
 
 		 1976 aa  111  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  27.93 
 
 		 1170 aa  111  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  29.96 
 
 		 1231 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3226  aldehyde dehydrogenase  31.15 
 
 		 1681 aa  109  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3587  exonuclease V subunit alpha  29.44 
 
 		 1699 aa  107  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1469  TrwC relaxase  27.37 
 
 		 1189 aa  104  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137376  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  27.32 
 
 		 1523 aa  104  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  27.32 
 
 		 1523 aa  104  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4107  MobA/MobL protein  35.43 
 
 		 310 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.372473 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  25.71 
 
 		 961 aa  102  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  25.77 
 
 		 710 aa  102  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  29.71 
 
 		 1665 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  27.39 
 
 		 1980 aa  97.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  29.17 
 
 		 926 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  29.75 
 
 		 1955 aa  96.3  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  24.71 
 
 		 870 aa  95.9  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  31.21 
 
 		 2090 aa  94.4  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0593  AAA ATPase  27.91 
 
 		 717 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0562  AAA ATPase  27.91 
 
 		 717 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0587  AAA ATPase  27.91 
 
 		 717 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004253  pDOJH10S_p2  Mob  29.58 
 
 		 492 aa  93.2  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  26.23 
 
 		 982 aa  93.6  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  28.4 
 
 		 733 aa  92.8  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  27.22 
 
 		 919 aa  92.8  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  29.66 
 
 		 637 aa  92.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08050  TrwC relaxase  28 
 
 		 1160 aa  92.4  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  28.64 
 
 		 1952 aa  92  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  29.49 
 
 		 936 aa  91.7  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  29.5 
 
 		 727 aa  91.7  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2919  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.96 
 
 		 721 aa  91.3  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>