182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5577 on replicon NC_009340
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  74.43 
 
 		 946 aa  1341    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  100 
 
 		 944 aa  1898    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  91.53 
 
 		 945 aa  1685    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  32.32 
 
 		 1797 aa  241  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  30.6 
 
 		 1174 aa  235  3e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  33.33 
 
 		 1836 aa  233  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  29.26 
 
 		 1967 aa  219  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  29.13 
 
 		 1976 aa  219  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  31.16 
 
 		 1955 aa  211  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  31.1 
 
 		 1523 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  31.1 
 
 		 1523 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  31.29 
 
 		 1952 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  29.96 
 
 		 1231 aa  201  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  28.74 
 
 		 1980 aa  192  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3254  exonuclease V subunit alpha  30.76 
 
 		 1529 aa  190  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  35.82 
 
 		 1184 aa  179  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8975  TrwC relaxase  29.18 
 
 		 1386 aa  179  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  27.26 
 
 		 1093 aa  171  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5396  TrwC relaxase  26.63 
 
 		 1623 aa  163  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.348117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  35.43 
 
 		 1176 aa  159  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  28.99 
 
 		 907 aa  155  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  22.9 
 
 		 1112 aa  140  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  35.29 
 
 		 2090 aa  137  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  26.56 
 
 		 918 aa  127  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  27.39 
 
 		 926 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  27.21 
 
 		 872 aa  124  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  27.74 
 
 		 961 aa  122  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  29.09 
 
 		 929 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  27.01 
 
 		 964 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  26.74 
 
 		 866 aa  117  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  26.82 
 
 		 1035 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  28.18 
 
 		 1107 aa  109  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.99 
 
 		 1356 aa  108  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12335  hypothetical protein  53.61 
 
 		 174 aa  107  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0858  TrwC relaxase  28.11 
 
 		 1208 aa  102  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  27.83 
 
 		 1102 aa  101  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  25.05 
 
 		 1170 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  31.83 
 
 		 952 aa  99.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  27.8 
 
 		 1102 aa  99  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  28.6 
 
 		 1107 aa  98.2  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  27.61 
 
 		 981 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  30.35 
 
 		 1557 aa  96.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  30.05 
 
 		 976 aa  95.9  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  30.05 
 
 		 976 aa  95.9  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  29.56 
 
 		 1039 aa  95.5  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  33.93 
 
 		 1111 aa  95.5  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  29.88 
 
 		 982 aa  95.5  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  30.1 
 
 		 1100 aa  95.1  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  30.23 
 
 		 1006 aa  95.1  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  31.55 
 
 		 952 aa  94.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  29.67 
 
 		 985 aa  94.7  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  29.5 
 
 		 1100 aa  93.6  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1944  conjugative relaxase domain-containing protein  27.08 
 
 		 910 aa  94.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  34.31 
 
 		 1175 aa  93.2  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3338  hypothetical protein  34.4 
 
 		 1520 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.389694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  32.73 
 
 		 379 aa  93.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  24.74 
 
 		 919 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  28.9 
 
 		 1123 aa  92.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  31.1 
 
 		 1034 aa  91.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  34.76 
 
 		 1549 aa  91.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1195  conjugative relaxase domain-containing protein  26.25 
 
 		 907 aa  90.1  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.844088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  28.5 
 
 		 1034 aa  90.1  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0253  TrwC relaxase  33.91 
 
 		 957 aa  88.6  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  28.1 
 
 		 998 aa  88.2  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08050  TrwC relaxase  29.43 
 
 		 1160 aa  87.4  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.44 
 
 		 1245 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  29.86 
 
 		 1000 aa  85.5  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  29.86 
 
 		 1000 aa  85.5  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  29.37 
 
 		 998 aa  85.1  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  32.47 
 
 		 1014 aa  84.7  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  27.26 
 
 		 943 aa  84  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  25.25 
 
 		 1665 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  33.33 
 
 		 1010 aa  83.2  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4481  conjugative relaxase domain-containing protein  24.36 
 
 		 907 aa  82.8  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  25.93 
 
 		 974 aa  82  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  29.51 
 
 		 968 aa  82.4  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  25.59 
 
 		 1481 aa  82  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4256  TrwC relaxase  31.79 
 
 		 1026 aa  82  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0016  TrwC relaxase  29.68 
 
 		 926 aa  80.9  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  23.54 
 
 		 870 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30 
 
 		 1538 aa  79  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4309  conjugal transfer nickase/helicase TraI  30.24 
 
 		 1807 aa  77  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3619  exonuclease V subunit alpha  26.48 
 
 		 1082 aa  77.4  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  30 
 
 		 814 aa  77.4  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7342  conjugative relaxase domain protein  31.55 
 
 		 1486 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.113583 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0010  conjugal transfer nickase/helicase TraI  30.28 
 
 		 1756 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0549712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1453  TrwC relaxase  29.04 
 
 		 1223 aa  76.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_21  protein TraI (DNA helicase I)  23.58 
 
 		 1936 aa  74.7  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  26.14 
 
 		 614 aa  73.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2022  TrwC relaxase  29.58 
 
 		 1112 aa  72.8  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715735  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.79 
 
 		 1105 aa  72.4  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1469  TrwC relaxase  25.51 
 
 		 1189 aa  71.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137376  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1790  TrwC relaxase  32.09 
 
 		 322 aa  70.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428161  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  25.39 
 
 		 1102 aa  70.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  26.05 
 
 		 1168 aa  70.5  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1955 aa  70.1  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3983  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1013 aa  70.1  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.23 
 
 		 1534 aa  69.7  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  27.81 
 
 		 1986 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  27.81 
 
 		 1986 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>