77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1790 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1790  TrwC relaxase  100 
 
 		 322 aa  664    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428161  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  41.02 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  34.29 
 
 		 1093 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  36.13 
 
 		 907 aa  116  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  37.01 
 
 		 981 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  35.32 
 
 		 1111 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  33.81 
 
 		 1035 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  34.84 
 
 		 1014 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  34.04 
 
 		 918 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7342  conjugative relaxase domain protein  35.21 
 
 		 1486 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.113583 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  33.19 
 
 		 1967 aa  95.9  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  33.48 
 
 		 1976 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  32.37 
 
 		 1010 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  35.07 
 
 		 961 aa  94  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  31.88 
 
 		 923 aa  93.6  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1955 aa  92.8  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  33.84 
 
 		 964 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  33.06 
 
 		 929 aa  90.9  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0253  TrwC relaxase  33.71 
 
 		 957 aa  90.1  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  34.06 
 
 		 1980 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  32.24 
 
 		 936 aa  86.7  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  35.88 
 
 		 1231 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  34.65 
 
 		 926 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  28.87 
 
 		 1986 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  28.87 
 
 		 1986 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  28.87 
 
 		 1986 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  28.87 
 
 		 1986 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  28.87 
 
 		 1986 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4614  conjugative transfer relaxase protein TraI  28.87 
 
 		 1986 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.441431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  30.23 
 
 		 2090 aa  79  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  31.58 
 
 		 1176 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1944  conjugative relaxase domain-containing protein  29.39 
 
 		 910 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  32.14 
 
 		 1836 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_21  protein TraI (DNA helicase I)  30.05 
 
 		 1936 aa  77  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3983  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1013 aa  77  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  35.29 
 
 		 945 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  35.29 
 
 		 946 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4309  conjugal transfer nickase/helicase TraI  34.39 
 
 		 1807 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  29.39 
 
 		 870 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2183  TrwC protein  32.92 
 
 		 542 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1195  conjugative relaxase domain-containing protein  32.79 
 
 		 907 aa  72.8  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.844088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4256  TrwC relaxase  30.18 
 
 		 1026 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0010  conjugal transfer nickase/helicase TraI  32.85 
 
 		 1756 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0549712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  27.87 
 
 		 919 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  30.31 
 
 		 1665 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4481  conjugative relaxase domain-containing protein  32.52 
 
 		 907 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  32.09 
 
 		 944 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  27.97 
 
 		 943 aa  70.1  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2354  conjugative relaxase domain protein  29.3 
 
 		 1351 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  29.82 
 
 		 1175 aa  69.3  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  28.85 
 
 		 982 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  33.91 
 
 		 1797 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  29.65 
 
 		 1170 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6204  conjugative relaxase domain-containing protein  28.51 
 
 		 1087 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  25.84 
 
 		 1112 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1469  TrwC relaxase  32.87 
 
 		 1189 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137376  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  29.29 
 
 		 1174 aa  66.6  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8975  TrwC relaxase  31.9 
 
 		 1386 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3254  exonuclease V subunit alpha  41.11 
 
 		 1529 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  30.57 
 
 		 1955 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5396  TrwC relaxase  26.56 
 
 		 1623 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.348117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  28.71 
 
 		 1184 aa  63.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  32.46 
 
 		 1952 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  29.87 
 
 		 1523 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3338  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1520 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.389694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  29.87 
 
 		 1523 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  34.74 
 
 		 1549 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3692  TrwC relaxase  29.02 
 
 		 1068 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.372056 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0576  TrwC relaxase  32.14 
 
 		 669 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230411  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3542  aldehyde dehydrogenase  27.17 
 
 		 1683 aa  53.9  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311883  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3226  aldehyde dehydrogenase  26.09 
 
 		 1681 aa  52.8  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3587  exonuclease V subunit alpha  26.09 
 
 		 1699 aa  52.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246341 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3619  exonuclease V subunit alpha  30.07 
 
 		 1082 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  23.14 
 
 		 1481 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0858  TrwC relaxase  32 
 
 		 1208 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1453  TrwC relaxase  35.4 
 
 		 1223 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2022  TrwC relaxase  36.28 
 
 		 1112 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>