143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3734 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  68.24 
 
 		 1523 aa  1645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  43.52 
 
 		 1967 aa  991    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  41.82 
 
 		 1980 aa  975    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  44.95 
 
 		 1797 aa  1064    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  43.87 
 
 		 1976 aa  987    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  68.24 
 
 		 1523 aa  1645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3254  exonuclease V subunit alpha  68.57 
 
 		 1529 aa  1669    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  100 
 
 		 1952 aa  3874    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  92.84 
 
 		 1955 aa  3491    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  49.39 
 
 		 2090 aa  1211    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  48.85 
 
 		 1836 aa  1082    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5396  TrwC relaxase  37.95 
 
 		 1623 aa  561  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.348117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8975  TrwC relaxase  36.65 
 
 		 1386 aa  543  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  35.05 
 
 		 1174 aa  478  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  34.3 
 
 		 1184 aa  463  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0253  TrwC relaxase  36.8 
 
 		 957 aa  452  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  35.89 
 
 		 1175 aa  428  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  37.51 
 
 		 1176 aa  410  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  35.45 
 
 		 1231 aa  325  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4256  TrwC relaxase  40.62 
 
 		 1026 aa  252  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  31.04 
 
 		 944 aa  207  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  32.29 
 
 		 946 aa  150  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  32.41 
 
 		 945 aa  145  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  28.45 
 
 		 929 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0016  TrwC relaxase  29.07 
 
 		 926 aa  125  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08050  TrwC relaxase  27.8 
 
 		 1160 aa  122  7.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  26.59 
 
 		 907 aa  121  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  27.31 
 
 		 872 aa  120  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2022  TrwC relaxase  26.81 
 
 		 1112 aa  115  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  26.98 
 
 		 1481 aa  110  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.51 
 
 		 1095 aa  108  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  26.58 
 
 		 881 aa  105  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  25.58 
 
 		 1170 aa  105  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  28.33 
 
 		 923 aa  102  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  22.03 
 
 		 1112 aa  101  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  28.81 
 
 		 866 aa  100  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  28.78 
 
 		 952 aa  100  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.98 
 
 		 1102 aa  100  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  27.12 
 
 		 1014 aa  100  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  26.37 
 
 		 1549 aa  100  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  26.84 
 
 		 879 aa  99.4  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  28.31 
 
 		 952 aa  99  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1195  conjugative relaxase domain-containing protein  25.65 
 
 		 907 aa  99  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.844088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.74 
 
 		 1098 aa  97.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  30.91 
 
 		 1034 aa  96.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  27.32 
 
 		 1039 aa  95.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  27.59 
 
 		 1010 aa  95.9  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  29.55 
 
 		 998 aa  95.5  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  29.32 
 
 		 976 aa  95.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  29.32 
 
 		 976 aa  95.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  26.93 
 
 		 974 aa  94.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  27.82 
 
 		 985 aa  93.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  29.67 
 
 		 1006 aa  93.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.71 
 
 		 1105 aa  93.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  26.74 
 
 		 1098 aa  92.8  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  29.09 
 
 		 1000 aa  90.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  29.09 
 
 		 1000 aa  90.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  26.43 
 
 		 1035 aa  90.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  31.47 
 
 		 981 aa  91.3  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.19 
 
 		 1356 aa  90.5  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  25.46 
 
 		 1665 aa  89.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1453  TrwC relaxase  26.35 
 
 		 1223 aa  89.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  28.57 
 
 		 998 aa  89  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  27.39 
 
 		 926 aa  89  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  29.22 
 
 		 982 aa  87.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2354  conjugative relaxase domain protein  26.58 
 
 		 1351 aa  86.7  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3619  exonuclease V subunit alpha  29.19 
 
 		 1082 aa  85.9  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  32.89 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  26.62 
 
 		 1107 aa  84  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28 
 
 		 1245 aa  84  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  28.19 
 
 		 1034 aa  83.2  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  28.13 
 
 		 968 aa  82  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  28.7 
 
 		 1025 aa  80.1  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  26.45 
 
 		 1102 aa  79.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  31.42 
 
 		 1111 aa  79.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.43 
 
 		 1538 aa  79  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  27.83 
 
 		 1107 aa  78.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  26.2 
 
 		 1102 aa  78.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  26.95 
 
 		 1093 aa  77.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4481  conjugative relaxase domain-containing protein  24.59 
 
 		 907 aa  77.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2183  TrwC protein  27.57 
 
 		 542 aa  77.4  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964158  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  25.47 
 
 		 1100 aa  77  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  26.9 
 
 		 1123 aa  76.3  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  27.05 
 
 		 1100 aa  75.9  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  28.05 
 
 		 814 aa  75.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  27.39 
 
 		 1557 aa  74.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  23.47 
 
 		 870 aa  71.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3983  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1013 aa  71.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.43 
 
 		 1534 aa  70.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1944  conjugative relaxase domain-containing protein  25.75 
 
 		 910 aa  70.1  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  31.55 
 
 		 918 aa  68.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0576  TrwC relaxase  33.33 
 
 		 669 aa  68.6  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230411  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  31.43 
 
 		 936 aa  67.4  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1790  TrwC relaxase  32.46 
 
 		 322 aa  67.4  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428161  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  26.8 
 
 		 1536 aa  67.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  30.64 
 
 		 961 aa  64.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4309  conjugal transfer nickase/helicase TraI  30.94 
 
 		 1807 aa  63.2  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3338  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1520 aa  62.4  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.389694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  31.28 
 
 		 1168 aa  62.4  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  30.59 
 
 		 964 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>