176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3615 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  100 
 
 		 1481 aa  2972    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  29.81 
 
 		 1836 aa  153  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  26.54 
 
 		 1976 aa  140  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.15 
 
 		 1098 aa  138  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.57 
 
 		 1098 aa  137  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  29.26 
 
 		 998 aa  135  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.37 
 
 		 1356 aa  135  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.67 
 
 		 1536 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  32.71 
 
 		 1025 aa  133  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  26.22 
 
 		 1184 aa  132  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  29.86 
 
 		 952 aa  132  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.77 
 
 		 1105 aa  131  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.12 
 
 		 1095 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.33 
 
 		 1102 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  30.09 
 
 		 952 aa  131  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  24.74 
 
 		 907 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  30.59 
 
 		 814 aa  130  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  30.36 
 
 		 1039 aa  129  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  27.84 
 
 		 1797 aa  127  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  30.07 
 
 		 1107 aa  125  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  26.27 
 
 		 1174 aa  124  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  26.4 
 
 		 918 aa  123  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  28.68 
 
 		 1102 aa  123  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  30.27 
 
 		 998 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  28.42 
 
 		 1102 aa  122  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  28.82 
 
 		 1523 aa  121  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  28.82 
 
 		 1523 aa  121  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  30.03 
 
 		 1107 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  30.42 
 
 		 968 aa  121  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8975  TrwC relaxase  25.79 
 
 		 1386 aa  121  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  27.47 
 
 		 974 aa  120  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.17 
 
 		 1245 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  30.19 
 
 		 982 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  28.68 
 
 		 985 aa  120  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  29.98 
 
 		 1034 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  30.14 
 
 		 1006 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  25.79 
 
 		 1093 aa  116  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  30.68 
 
 		 1034 aa  115  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  27.84 
 
 		 1955 aa  115  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  28.72 
 
 		 1123 aa  114  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  28.76 
 
 		 1100 aa  112  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  29.46 
 
 		 1557 aa  112  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  28.79 
 
 		 1100 aa  112  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  26.98 
 
 		 1952 aa  112  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  28.33 
 
 		 976 aa  112  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  28.33 
 
 		 976 aa  112  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.17 
 
 		 1534 aa  112  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  24.86 
 
 		 961 aa  110  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  25.8 
 
 		 1549 aa  110  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3254  exonuclease V subunit alpha  26.54 
 
 		 1529 aa  108  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.92 
 
 		 1538 aa  107  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0253  TrwC relaxase  26.25 
 
 		 957 aa  105  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  29.91 
 
 		 1000 aa  105  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  29.91 
 
 		 1000 aa  105  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  26.11 
 
 		 1175 aa  100  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  25.32 
 
 		 879 aa  99.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  24.29 
 
 		 1170 aa  98.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  24.8 
 
 		 881 aa  98.2  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  24.91 
 
 		 943 aa  94.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5396  TrwC relaxase  25 
 
 		 1623 aa  92  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.348117 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  28.51 
 
 		 1168 aa  90.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  25.77 
 
 		 946 aa  90.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  26.99 
 
 		 936 aa  87.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  29.4 
 
 		 1967 aa  87  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  25.94 
 
 		 919 aa  85.9  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  27.14 
 
 		 929 aa  84  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  26.27 
 
 		 1980 aa  80.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  26.09 
 
 		 944 aa  79.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1469  TrwC relaxase  23.79 
 
 		 1189 aa  76.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137376  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  23.34 
 
 		 1010 aa  76.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  25.22 
 
 		 923 aa  74.3  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3338  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1520 aa  74.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.389694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  22.72 
 
 		 964 aa  74.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  25.52 
 
 		 981 aa  73.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  31.89 
 
 		 2090 aa  72.4  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  25.53 
 
 		 740 aa  72.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  22.56 
 
 		 982 aa  71.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  26.11 
 
 		 945 aa  70.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  38.39 
 
 		 1231 aa  68.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  26.29 
 
 		 741 aa  67.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  27.65 
 
 		 1176 aa  67  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  27.23 
 
 		 637 aa  67  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2183  TrwC protein  25.41 
 
 		 542 aa  64.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964158  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  26.1 
 
 		 379 aa  64.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  24.31 
 
 		 1665 aa  64.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  26.42 
 
 		 728 aa  64.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3587  exonuclease V subunit alpha  25.93 
 
 		 1699 aa  63.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0188  putative helicase  24.15 
 
 		 788 aa  63.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609464  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  25.54 
 
 		 739 aa  62.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3692  TrwC relaxase  22.65 
 
 		 1068 aa  62.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.372056 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4256  TrwC relaxase  29.05 
 
 		 1026 aa  61.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  28.04 
 
 		 866 aa  61.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  23.62 
 
 		 1014 aa  61.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  24.67 
 
 		 870 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  23.97 
 
 		 735 aa  61.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  25.3 
 
 		 728 aa  61.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  27 
 
 		 1955 aa  61.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  23.89 
 
 		 749 aa  60.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  30.27 
 
 		 733 aa  60.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  35.58 
 
 		 1111 aa  60.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>