217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1430 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  50.68 
 
 		 1836 aa  1051    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  100 
 
 		 1523 aa  3013    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  51.23 
 
 		 2090 aa  1146    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  45.25 
 
 		 1967 aa  984    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  43.73 
 
 		 1980 aa  897    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  47.19 
 
 		 1797 aa  995    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  45.72 
 
 		 1976 aa  988    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  100 
 
 		 1523 aa  3013    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3254  exonuclease V subunit alpha  77.53 
 
 		 1529 aa  2167    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  68.24 
 
 		 1952 aa  1660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  68.01 
 
 		 1955 aa  1671    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8975  TrwC relaxase  37.77 
 
 		 1386 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5396  TrwC relaxase  36.87 
 
 		 1623 aa  566  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.348117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  34.31 
 
 		 1174 aa  463  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  34.19 
 
 		 1184 aa  461  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  34.64 
 
 		 1176 aa  436  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0253  TrwC relaxase  35.28 
 
 		 957 aa  433  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  36.6 
 
 		 1175 aa  429  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4256  TrwC relaxase  33.17 
 
 		 1026 aa  363  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  33.59 
 
 		 1231 aa  336  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  28 
 
 		 1093 aa  171  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  31.42 
 
 		 946 aa  169  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  33.12 
 
 		 945 aa  160  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  33.33 
 
 		 944 aa  155  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  26.76 
 
 		 907 aa  145  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  28.76 
 
 		 981 aa  141  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0016  TrwC relaxase  30.17 
 
 		 926 aa  138  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08050  TrwC relaxase  27.4 
 
 		 1160 aa  137  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2022  TrwC relaxase  28.78 
 
 		 1112 aa  133  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  27.72 
 
 		 1481 aa  133  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  30.44 
 
 		 1107 aa  132  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  32.65 
 
 		 1356 aa  130  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  26.48 
 
 		 1549 aa  130  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  27.84 
 
 		 929 aa  129  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.49 
 
 		 1105 aa  124  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  31.74 
 
 		 1000 aa  122  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  31.74 
 
 		 1000 aa  122  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  33.42 
 
 		 866 aa  122  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  33.92 
 
 		 872 aa  121  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0858  TrwC relaxase  28.08 
 
 		 1208 aa  118  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  30.53 
 
 		 998 aa  117  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  31.04 
 
 		 923 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  28.35 
 
 		 1039 aa  116  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  26.37 
 
 		 918 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  30.86 
 
 		 1034 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  26.58 
 
 		 881 aa  112  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  29.93 
 
 		 1025 aa  112  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  30.65 
 
 		 976 aa  112  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  30.65 
 
 		 976 aa  112  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  29.4 
 
 		 998 aa  112  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1453  TrwC relaxase  27.59 
 
 		 1223 aa  112  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  29.17 
 
 		 1107 aa  110  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.9 
 
 		 1095 aa  110  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  27.83 
 
 		 985 aa  110  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  28.47 
 
 		 1100 aa  109  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  29.67 
 
 		 974 aa  108  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  25.86 
 
 		 879 aa  108  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  28.54 
 
 		 952 aa  107  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  28.34 
 
 		 1100 aa  105  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  29.52 
 
 		 1006 aa  104  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  29.74 
 
 		 1102 aa  103  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  26.65 
 
 		 1102 aa  103  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3619  exonuclease V subunit alpha  30.21 
 
 		 1082 aa  103  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  29.4 
 
 		 1102 aa  103  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  26.75 
 
 		 1665 aa  103  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  28.93 
 
 		 952 aa  102  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  30.42 
 
 		 982 aa  101  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  22.81 
 
 		 1112 aa  101  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  28.55 
 
 		 936 aa  101  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  30.32 
 
 		 968 aa  101  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  25.08 
 
 		 1170 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.02 
 
 		 1098 aa  100  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  28.63 
 
 		 1034 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  28.27 
 
 		 1123 aa  98.6  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  26.78 
 
 		 1014 aa  95.5  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1195  conjugative relaxase domain-containing protein  24.97 
 
 		 907 aa  94.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.844088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.09 
 
 		 1245 aa  93.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.52 
 
 		 1534 aa  93.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  26.94 
 
 		 1098 aa  92  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.27 
 
 		 1536 aa  91.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  28.43 
 
 		 1010 aa  89.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  29.49 
 
 		 814 aa  89.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4481  conjugative relaxase domain-containing protein  25.21 
 
 		 907 aa  88.6  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  32.74 
 
 		 1111 aa  88.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  25.61 
 
 		 943 aa  87  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  29.95 
 
 		 1557 aa  84  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  25.35 
 
 		 1035 aa  80.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  33.14 
 
 		 379 aa  79.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.89 
 
 		 1538 aa  78.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  28.8 
 
 		 637 aa  76.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2183  TrwC protein  27.52 
 
 		 542 aa  76.3  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2919  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.03 
 
 		 721 aa  69.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2354  conjugative relaxase domain protein  30.9 
 
 		 1351 aa  68.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1790  TrwC relaxase  29.87 
 
 		 322 aa  67.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428161  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  31.56 
 
 		 1955 aa  67  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  28.97 
 
 		 736 aa  66.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  28.25 
 
 		 735 aa  65.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  25.78 
 
 		 1168 aa  65.9  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0576  TrwC relaxase  29.8 
 
 		 669 aa  65.9  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230411  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  26.56 
 
 		 731 aa  64.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>